Genetic Algorithms for structure prediction of new molecular Crystals: methodology and applications

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 960

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

MHAA01_017

تاریخ نمایه سازی: 17 اسفند 1393

چکیده مقاله:

This article describes the application of our distributed computing framework for crystal structure prediction (CSP), the modified genetic algorithms for crystal and cluster prediction (MGAC), to predict the crystal structure of bithiazole molecules. Using a distributed parallel genetic algorithm and local energy minimization of the structures followed by the classifying, sorting, and archiving of the most relevant structures. A genetic algorithm has been used to generate plausible crystal structures from the knowledge of only the unit cell dimensions and constituent elements. This strategy increases the efficiency of the DFT based GA by several orders of magnitude. This gain allows considerable increase in size and complexity of systems that can be studied by first principles. The Gaussian 03 package is used to perform the calculation of these atomic charges at the optimized geometry (HF/6-31G*level).Our results indicate that the method can consistently find the experimentally known crystal structures of bithiazole molecules. The structural of computational parameters are in agreement with the experimental data

نویسندگان

Akram Hossenian

Department of Engineering Science, College of Engineering, University of Tehran, P.O. Box۱۱۳۶۵-۴۵ Tehran,Islamic Republic of Iran

Amin Ghodousian

Department of Engineering Science, College of Engineering, University of Tehran, P.O. Box۱۱۳۶۵-۴۵۶۳ Tehran, Islamic Republic of Iran Professor Assistant and Applied mathematics (optimization)

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • A. Gavezzotti, Accounts of Chemical Research 27, 309 (1994). ...
  • ]. Pannetier, ]. Bassas-Alsina, ]. Ro driguez-Carvaj al, and V. ...
  • ]. C. Schon and M. Jansen, Angew. Chem. Int. Ed ...
  • R. Marton'ak, A. Laio, and M. Parrinello, Phys. Rev. Lett. ...
  • A. R. Oganov and C. W. Glass, ]. Chem. Phys. ...
  • A. R. Oganov, A. O. Lyakhov, and M. Valle, Acc. ...
  • C. M. Freeman, ]. M. Newsam, S. M. Levine, and ...
  • D.]. Wales and]. P. K. Doye, ]. Phys. Chem. A ...
  • S. Goedecker, ]. Chem. Phys. 120, 9911 (2004). ...
  • S. Curtarolo et al., Phys. Rev. Lett. 91, 135503 (2003). ...
  • Wang Y, Lv], Zhu L and Ma Y 2010 Crystal ...
  • Wang Y, Lv], Zhu L and Ma Y 2012 CALYPSO: ...
  • Pickard C] and Needs R] 2011 Ab Initio Random Structure ...
  • S. L. Price, Adv. Drug Del. Rev. 56, 301 (2004). ...
  • I. A. Baburin, S. Leoni, and G. Seifert, The Journal ...
  • Maddox, Crystals from First Principles Nature 335, 201 (1988). ...
  • A. Gavezzotti, Accounts of Chemical Research 27, 309 (1994). ...
  • نمایش کامل مراجع