بررسی ساختار ژنومی جدایه های ایرانی بورخولدریامالئی با استفاده از روش آنالیز متکی بر واحدهای پشت سر هم تکرار شونده (VNTR)
محل انتشار: اولین کنگره ملی زیست شناسی و علوم طبیعی ایران
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 705
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
BSCONF01_509
تاریخ نمایه سازی: 15 بهمن 1393
چکیده مقاله:
مشمشه یکی از مهمترین بیماریهای زئونوز بوده که توسط باکتری بورخولدریا مالئی ایجاد میگردد. یکی از روشهای مولکولی در جهت شناسایی سویه های در گردش و مولکولار اپیدمیولوژی بورخولدریا مالئی استفاده از واحدهای تکرار شونده ژنومی معروف به Tandem repeat میباشد که به دلیل مشاهده تنوع در تعداد آنها در مناطق خاصی از ژنوم سبب شناسایی تنوع در میان سویه های باکتری میگردند. در مطالعه حاضر با استفاده از روش MLVA دو لوکوس پایه به نامهای Bm1367 و Bm140 انتخاب و جهت ارزیابی تکنیک VNTR classic مجدداً طراحی پرایمر و بهینه سازی صورت پذیرفت. از سوی دیگر یک لوکوس جدید نیز به نام Bm41 با کمک نرم افزار Tandem repeat finder طراحی و به مجموعه فوق اضافه گردید. آزمون های PCR در ابتدا به صورت مستقل و سپس هر سه آزمون توسط یک پروتکل واحد فراهم گردید. بعد از توالی یابی محصول PCR شناسایی و تعیین دقیق تعداد تکرارهای ژنتیکی در هر لوکوس با استفاده از نرم افزارهای Tandem Repeat Finder و Clustal X صورت پذیرفت و تنوع ژنتیکی در بین جدایه های مورد مطالعه بررسی و در سه تیپ ژنتیکی قرار گرفت.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
رضا نجف پور
دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، دانشکده علوم پایه، بخش میکروبیولوژی، شهرکرد، ایران
نادر مصوری
موسسه تحقیقات وسرم سازی رازی، بخش توبرکولین، مالئین و یونین، کرج، ایران
کیوان تدین
موسسه تحقیقات وسرم سازی رازی، بخش واکسنهای هوازی، کرج، ایران
الهه تاج بخش
دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، دانشکده علوم پایه، بخش میکروبیولوژی، شهرکرد، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :