مطالعه، شناسایی و توالی یابی ساختارهای ژنی سیکلوتیدی گیاه بنفشه سه رنگ (Viola tricolor)

سیکلوتیدها بزرگترین خانواده از پروتئین های حلقوی هستند که به طور عمده در گیاهان سه خانواده ی گیاهیRubiaceae,Cucurbitaceae و Violaceaceیافت گردیده اند. ساختار پیچیده ی این پروتئین های کوچک متشکل از تقریبا 30 باقیمانده آمینواسیدی و موتیف حلقوی سیستئین نات می باشد. سیکلوتیدها نقش مهمی در سیستم دفاعی گیاهان با خاصیت کشندگی حشرات داشته، به علاوه اثرات سمیت سلولی، خاصیت ضد میکروبی، ضدHIVو همولیتیکی نیز دارند. این پپتیدهای حلقوی محصولات ژنی طبیعی بوده و سنتزریبوزومی دارند و به خاطر پایداری فوق العاده خود به عنوان الگوهایی برای مهندسی پروتئین و ابزار طراحی دارو امروزه بسیار مورد توجه قرار گرفته اند. از اینرو مطالعه و تعیین ساختار ژنی این پپتیدها بسیار حائز اهمیت است. در این مطالعه عمده ی محتوا و ساختار ژنی سیکلوتیدهای موجود در گیاه بنفشه سه رنگ ایرانی، با استفاده از یک پرایمر دژنره طراحی شده برای توالی حفاظت شده ی موتیف(AAFALPA)موجود در توالی سیگنال شبکه آندوپلاسمی پیش ساز سیکلوتیدی، مورد غربالگریcDNAقرار گرفت. بدین منظور استخراجRNAتام از بافت تازهی گیاهی و سپس سنتزcDNAانجام گرفت که با استفاده از پرایمر مذکور و پرایمر الیگوdT20,درشرایط مناسبPCRانجام گردیده و باند مربوطه استخراج و کلون شد و پلاسمیدهای مربوط به چند کلونی متفاوت توالی یابی وساختارهای ژنی متعددی شناسایی و آنالیز گردیدند

کلیدواژه ها:

بنفشه سه رنگ ایرانی ، سیکلوتیدها ، ساختار ژنی ، غربالگریcDNA