تعیین موقعیت تاکسونومیکی عامل لکه برگی باکتریایی پامچال در استان مازندران

بررسی حاضر به منظور ارزیابی موقعیت تاکسونوم کیی جدایههای عامللکهبرگی ناشی از گونهای زانتوموناس در پامچال وحشی ) primulavulgaris ( بدست آمده از چند منطقه جنگلی استان مازندران انجامگرفت. بدین منظور ابتدا DNA ژنومی جدایهها استخراج و با بکارگیریآغازگر gyrB عمل PCR انجام شد. به منظور امکان تف کیک محصول PCRجدایهها از کیدیگر هضم محصول PCR با آنزیم PstI صورت گرفت و درژل اکریل آمید الکتروفورز شد. از ضریب تشابه جاکارد برای تع یین تشابهجدایهها و از روش UPGAMA و نرم افزار NTSYS برای آنالیز خوشهایاستفاده شد. بر اساس دندروگرام رسم شده، جدایهها در سطح تشابه 60 %در 5 خوشه ژنوتیپی مختلف جای گرفتند. نمون ههای انتخاب شده براساس نتایج هضم آنزیمی، توالی یابی شد. توالی نوکلئوتیدی بدست آمده،پس از همردیف سازی چندگانه ) Multiple sequence alignment ( بابرنامه MEGA4 با سایر توالیهای مربوط به این ناحیه در گون ههای مختلفXanthomonas موجود در بانک ژن ) NCBI ( مقایسه شدند. نتایج نشانداد که جدایههای پامچال در سطح تشابه 98 % با گونه Xanthomonashortorum شباهت داشته و احتمالا جدایههای مورد آزمایش به پاتواریمجزا از سایر پاتوارهای گزارش شده این گونه تعلق دارند.

کلیدواژه ها:

xanthomonas ، RFLP و gyrB