انتخاب ژن حاوی اطلاعات و طبقه بندی داده های ریز آرایه با استفاده از الگوریتم ژنتیک و شبکه عصبی خودسازمان ده

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,102

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NANOO01_181

تاریخ نمایه سازی: 9 تیر 1393

چکیده مقاله:

تکنولوژی ریزآرایه به عنوان ابزار قدرتمندی جهت تحلیل و بررسی رفتار هزاران ژن نقش به سزایی در تشخیص کشف و بررسی روش های درمان در انواع بیماری ها به خصوص سرطان دارد در ساخت ریزآرایه از پروب هایی استفاده می شود که هر کدام شامل چندین باز متصل ویا ژن می باشد هر باز طولی به اندازه 0.33 نانو متر دارد این پروب ها توسط روبات های مخصوصی در ریزآرایه قرار می گیرند دقت پیش بینی بیماری ها توسط روش هایی که روی داده ای ریزآریاه اعمال می شود وابستگی زیادی به مقادیر این ژن ها دارد از مهم ترین ویژگی های داده های ریزآرایه ابعاد بالا در برابر تعداد کم نمونه ها می باشد این عامل باعص بروز مشکلاتی در تحلیل این نوع داده ها شده است بنابراین از روش های انتخاب ویژگی جهت حل این مشکلات و ارائه مدلی ساده تر و دقیق تر استفاده می شود در این مقاله روشی برای یافتن ژن های حاوی اطلاعات و همچنین طبه بندی داده ای ریزآرایه پیشنهاد شده است روش پیشنهادی از سه بخش اصلی تشکیل شده است در بخش اول ابعاد اده ها با روش آماری آزمون t و شبکه عصبی som کاهش می یابند در بخش دوم به وسیله الگوریتم ژنتیک زیر مجموعه ای بینه حاوی ژن ها استخراج می شوند و در آخرین بخش ژن های حاوی اطلاعات با ارزش انتخاب می گردند در این روش به علت استافده از شبکه عصبی som ژن های مشابه گروه بندی شده و نماینده آن ها برای اسخت مدل استفاده می شود و همین امر باعث کاهش زمان اجرای برنامه نسبت به روش های پیشین شده است روش پیشنهادی جهت طبه بندی داده ای سرطان سینه بکار گرفته شد و توانست دقت طبقه بندی را نسبت به روش های پیشنهادی قبلی از 89 درصد به 94 درصد برساند.

کلیدواژه ها:

شبکه عصبی خودسازمان ده ، ریزآرایه ، الگوریتم ژنتیک ، الگوریتم KNN سرطان سینه

نویسندگان

رقیه ابوالقاسمی

دانشجوی دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان

مهدی وثیقی

استادیار دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان

بهرام صادقی بی غم

استادیار دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان

لیلا جعفری

دانشجوی دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • ا4لین همابش هلی نانهتکنهله‌ژی _ محل برگزاری: همدان دانشکده شهید ...
  • Bacardit J (2004) Pittsburgh Genetics-Based Machine Learning in the Data ...
  • Bacardit J, Butz M (2007) Data mining in learning classifier ...
  • Bacardit J, Garrell J (2007) Bloat Control and Generalization Pressure ...
  • Bacardit J, Krasnogor N (2008) Empirical Evaluation of Ensemble Techniques ...
  • Bacardit J, Krasnogor N (2008) Fast rule representation for continuous ...
  • Bacardit J, Stout M, Hirst JD, Valencia A, Smith RE, ...
  • Bacardit J, Burke E, Krasnogor N (2009) Improving the scalability ...
  • Boulesteix A, Strimmer K (2007) Partial least squares: a versatile ...
  • Breiman L (2001) Random forests. Machine Learning 45: 5-32. ...
  • Chin S, Teschendorf A, Marioni J, Wang Y, _ arbosa-Moras ...
  • Duan, Kai-Bo, Rajapakse, Jagath C, Wang, Haiying, and Azuaje, Francisco. ...
  • Golub, Todd R, Slonim, Donna K, Tamayo, Pablo, Huard, Christine, ...
  • Habashy HO, Powe DG, Glaab E, Krasnogor N, Garibaldi JM, ...
  • Naderi A, Teschendorff A, B arbosa-Morais N, Pinder S, Green ...
  • Stout M, Bacardit J, Hirst J, Krasnogor N (2008) Prediction ...
  • Stout M, Bacardit J, Hirst JD, Smith RE, Krasnogor N ...
  • Tauler, Roma, Walczak, Beata, and Brown, Steven D. Comprehensive chemometrics ...
  • Tauler, Roma, Walczak, Beata, and Brown, Steven D. Comprehensive chemometrics ...
  • Tibshirani R, Hastie T, Narasimhan B, Chu G (2002) Diagnosis ...
  • Zhang H, Rakha E, Ball G, Spiteri I, Aleskandarany M, ...
  • نمایش کامل مراجع