واکاوی تبارزائی سه جدایه ویروس همراه با پیچیدگی برگ مو شماره یک (GLRaV-۱) از تاکستان های استان خراسان رضوی براساس توالی نوکلئوتیدی بخشی از ژن CPm۲

انگور (Vitis vinifera L.) به عنوان یک محصول کشاورزی مهم در جهان، میزبان طیف وسیعی از ویروس های گیاهی از جمله ۸۶ گونه ویروس شناخته شده است. یکی از این ویروس ها، ویروس همراه با پیچیدگی برگ مو شماره یک (Grapevine leafroll-associated virus ۱, GLRaV-۱) است که به جنس Ampelovirus و خانواده Closteroviridae تعلق دارد. با توجه به تغییرات اخیر در نام گذاری گونه های ویروسی، نام این گونه Ampelovirus univitis شده است. در این مطالعه در بهار سال ۱۳۹۹، آلودگی به GLRaV-۱ در تاکستان های شهرستان کاشمر، استان خراسان رضوی مورد بررسی قرار گرفت. علائم مشاهده شده در تاک های آلوده شامل زردی خفیف، تاخوردگی حاشیه برگ به پشت و قرمزی پهنک همراه با رگبرگ های سبز بود. ۷۰ نمونه از تاک های مشکوک به آلودگی جمع آوری و مورد آزمایش قرار گرفتند. نتایج نشان داد که ۲۲ نمونه (۴/۳۱ درصد از نمونه ها) به ویروس GLRaV-۱ آلوده بودند. توالی یابی ژن پروتئین پوششی فرعی ۲ (ORF CPm۲) ویروس از سه نمونه انجام شد. توالی های به دست آمده با توالی های موجود در GenBank مقایسه شدند و نتایج نشان داد که توالی نوکلئوتیدی جدایه های این مطالعه، شباهت ۷/۸۷ تا ۶/۷۷ درصدی با توالی های GLRaV-۱ موجود در GenBank داشتند. درخت تبارزایی براساس بخشی از توالی نوکلئوتیدی ژن CPm۲ بازسازی شد. جدایه های شمال شرق ایران با جدایه های سایر کشورها در یک گروه قرار گرفتند که نشان دهنده عدم ارتباط خوشه بندی تبارزایی با منشا جغرافیایی می باشد. این یافته نشان می دهد که ویروس GLRaV-۱ می تواند به راحتی در بین مناطق مختلف جغرافیایی جابه جا شود و تهدیدی جدی برای تاکستان ها در سراسر جهان محسوب می شود.

کلیدواژه ها:

Ampelovirus univitis ، پروتئین پوششی ، تحلیل تبارزائی ، کلستروویریده ، واکنش زنجیره ای پلی مراز رونویسی معکوس