بررسی شناسایی مسیرها و lncهای دخیل در گل دهی نخل خرما با استفاده از تکنیک RNA-Seq
محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 16، شماره: 4
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 292
فایل این مقاله در 28 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-16-4_007
تاریخ نمایه سازی: 14 بهمن 1403
چکیده مقاله:
چکیده: هدف: نخل خرما با نام علمی (Phoenix dactylifera L) گیاهی تک لپه و سازگار به نواحی گرمسیری و نیمه گرمسیری می باشد. رشد گل یکی از مراحل اصلی در ظهور ارگان متمرکز به تولیدمثل جنسی در گیاهان گل دار بوده و فرایندهای گلدهی توسط مجموعه ای بسیار پیچیده از مسیرهای کنترل شده توسط ژن های هویت مریستم گل، چرخه گل، هویت اندام گل و برخی lncRNAها حفاظت شده تکاملی تنظیم می شود. مطالعات مختلف روی موجودات به طور مداوم بیان بالایی از lncRNAها را در اندام های تولیدمثلی نشان می دهد. مواد و روش ها : به منظور دستیابی به شناسایی مسیرها و lncهای دخیل در گل دهی نخل خرما با استفاده از تکنیک RNA-Seq، نمونه های جوانه گل از نخل های خرمای ایستگاه تحقیقاتی میناب (استان هرمزگان) جمع آوری و به پژوهشکده زیست فناوری کشاورزی طبرستان منتقل شدند. RNAی کل از نمونه های جمع آوری شده از جوانه گل ارقام مختلف نر و ماده استخراج و به نسبت مساوی با یکدیگر مخلوط شده و در انتها، دو تکرار از هر نمونه ادغام شده به دست آمد و برای توالی یابی ارسال شد. پس از دریافت نتایج توالی یابی آنالیزهای موردنیاز با استفاده از نرم افزارهای مناسب انجام شد.نتایج: نتایج تحقیق حاضر نشان داد که lncRNAهای زیادی در مسیرهای گل دهی نخل خرما در سه مسیر تناوب نوری (سیزده مورد)، خودانگیزی (یک مورد) و مسیر جیبرلین (چهار مورد) نقش داشتند درحالی که در مسیر بهاره سازی هیچ lncRNA شناسایی نشد. در ادامه lncRNAهای شناسایی شده بر اساس توالی با lncRNAهای گزارش شده در سایر گیاهان مورد مقایسه قرار گرفتند که نتایج نشان داد که lncRNA شناسایی شده مرتبط با مسیر تناوب نوری، با موارد گزارش شده در گیاهانی چون نخل روغنی، شبدر قرمز، زیتون و گندم مشابه بودند و افزایش بیان آن منجر به گل دهی سریع و مستقل از تناوب نوری در گیاهان می شود. یک lncRNA شناسایی شده مرتبط با مسیر جیبرلین، با lncRNA گزارش شده در پنبه که مرتبط با ژن LFY بود، مشابهت داشت. چهار lncRNA شناسایی شده مرتبط با مسیر خودانگیزی، با lncRNAهای موجود در سیب، ارزن و نخودفرنگی مشابه بود و با ژن FCA دخیل در مسیر خودانگیزی مرتبط بود. نتیجهگیری: فرایند گل دهی در گیاهان تنها در فصل های معینی از سال، به واسطه شبکه های تنظیمی حاصل از سیگنال های محیطی و منتج از فرایند ژن های دخیل در چهار مسیر تنظیمی گل دهی، شامل تناوب نوری، بهاره سازی، خودانگیزی و جیبرلین صورت می گیرد. شناسایی و مقایسهlncRNAهای دخیل در مسیرهای مختلف گل دهی و شناسایی ژن های مرتبط با آنها زمینه را برای انجام تحقیقات آتی کاربردی در این گیاه ارزشمند فراهم می نماید.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
شهین مددی
گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی،دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران
صالحه گنجعلی
گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی ،دانشگاه زابل، زابل، ایران
لیلا فهمیده
گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منایع طبیعی گرگان، گرگان، ایران
حامد حسن زاده خانکهدانی
کارشناس بخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی هرمزگان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج
حدیث کرد
محقق پست دکتری، گروه بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقاتی آیپک آلمان، آلمان
رضا حقی دره ده
محقق پست دکتری، گروه بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقاتی آیپک آلمان، آلمان
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
