تاثیر نرخ شیوع بیماری بر عملکرد روش های جنگل تصادفی و بیز آستانه ای A

هدف از تحقیق حاضر، بررسی نقش نرخ شیوع بیماری در جمعیت مرجع و معماری های مختلف ژنومی بر عملکرد روش جنگل تصادفی و بیز A در صفات آستانه ای بود. بدین منظور، جمعیت های ژنومی برای سطوح متفاوت وراثت پذیری۰/۰۵ و ۰/۲۵ سطوح مختلف LD پایین و بالا و تعداد متفاوت جایگاه های صفات کمی ۱۵۰ و ۶۰۰ بر روی ۳۰ کروموزم شبیه سازی شدند. جهت ایجاد فنوتیپ دودویی با نسبت های مختلف شیوع بیماری، ابتدا برای ۵ درصد حیوانات جمعیت مرجع که کم ترین میانگین فنوتیپی را داشتند کد یک (یا بیمار) و ۹۵درصد دیگر کد صفر (یا سالم) در نظر گرفته شد. این روند باافزایش یک نرخ ۵ درصدی تا زمانی که ۵۰ درصد افرادجمعیت مرجع کد یک داشتند ادامه یافت. صحت ژنومی در هر دو روش جنگل تصادفی و بیز A، با افزایش نرخ شیوع بیماری از ۵ به ۲۰ درصد، افزایش و پس از آن تا رسیدن به ۵۰ درصد، کاهش یافت.در مجموع روش جنگل تصادفی نسبت به بیز A نوسانات بیشتری به تغییرات معماری ژنومی و نرخ شیوع بیماری داشت

کلیدواژه ها:

ارزش اصلاحی ، صحت ژنومی ، عدم تعادل پیوستگی