بررسی تشابه توالی کیتیناز در برخی از Actinobacteria

کیتینازها آنزیم های هیدرولیتیکی هستند که باندهای کیکوزیدی ماکرومولکول کیتین را می کنند . کیتین جزئی از دیواره سلولی قارچ ها و اسکلت خارجی بعضی از جانوران است. باکتریهای حاوی کیتیناز به برخی از جانوران و قارچ ها حمله کرده و بقایای آنها را تجزیه می کنند. بحث در خصوص تشابه و تفاوت های احتمالی متناسب با ژن های کد کننده ی کیتیناز منعلق به جنس و گونه های مختلف شاخه ی اکتینو باکتریا از پایگاه اطلاعاتی NCBI استخراج و داده های فیلوژنتیکی توسط نرم افزاری 5 MEGA به روش ماکسیموم پارسیمونی خوشه بندی شدند. توالی های مورد مقایسه در سطوح مختلف در بین این گروه تشابهات و تفاوت های قابل توجهی را نشان دادند. دندروگرام حاصل نشان داد که گونه های Streptomyces coelicolor S. lividans و S. prasinopilosus با چند گونه متعلق به جنس های مختلف اعضای این شاخه شامل Kibdelosporangium aridum و Planobispora rosea بدون اختلاف در کنار یکدیگر قرار می گیرند. با توجه به اهمیت این آنزیم در بیماری زایی باکتریها به نظر می رسد این توالی ها می توانند کاندیدی برای مطالعات فیلوژنتیکی نیز باشند . موضوع قابل پیگیری بعدی پس از شباهت ها و تفاوت های فوق می تواند مطالعه بیوانفورماتیکی ساختار سه بعدی این آنزیم ها و احیانا عمل محصولات انها ، جداسازی و همانه سازی ژن های مربوطه و انتقال انها به گیاه به عنوان ژن مقاومت و تحریک بیان آن بیش از حالت طبیعی باشد.

کلیدواژه ها:

کیتیناز ، MEGA5 ، آنالیز فیلوژنتیکی