استفده از داده های بیان ژن در تعیین شبککه ی برهمکنش ژن های افزایش بیان یافته موثر بر صفت باروری گاو شیری

تولیدمثل و باروری برای صنعت دامپروری اهمیت بسیار زیادی دارد و برای تولیدکنندگان دام نیز، مسائلی مانند تولید شری، تولید گوشت، و ... اهمیت دارد. تحلیل و تفسیر اطلاعات ژنومیک در مطالعات بیوانفورماتیک، از اهمیت بسزایی برخوردار است. از بیوانفورماتیک برای مطالعه ساختار و عملکرد ژنوم و پروتئین ها استفاده می شود. با توجه به اهمیت باروری در دامپروری، پژوهش هایی در زمینه داده های بیان ژن و ژن های افزایش بیان مرثر بر صفت باروری گاو شیری در رابطه با این موضوع انجام می شود تا بتوان بهبودهایی در عملکرد باروری دام ها داشت. این پژوهش با هدف بررسی تاثیر شبکه های برهم کنش ژن های افزایش بیان یافته موثر بر صفت باروری گاو شیری با استفاده از داده های بیان ژنی انجام شده است که در آن ابتدا ژن های مرتبط با باروری در گاو، از پایگاه اطلاعاتی NCBI استخراج شد، سپس توسط GEO۲R و با استفاده از نرم افزار R (نسخه ۳/۲/۳) نتایج، تجزیه و تحلیل گردید و در مرحله بعدی، شبکه ی میان ژنی، توسط پایگاه اطلاعاتی String ایجاد گردید و همچنین از پایگاه DAVID برای مطالعه بیولوژیکی ژن ها، استفاده شد. یافته های تحقیق حاضر نشان داد ژن های به دست آمده از جمله CDK۱, NDC۸۰, POLA۲, UQCRH, SEC۶۱G, CCT۲ و SSBP۱ به وسیله مسیرهای بیولوژیکی در فرایند بتروری دخیل هستند و این ژن ها ممکن است نقش های مختلفی در بیولوژی باروری دام ها ایفا کنند. از یافته های این پژوهش، می توان در مطالعات پویش ژنوم (GWAS) در امر ارزیابی ژنتیکی گاوهای شیری استفاده نمود.

کلیدواژه ها:

باروری گاو شیر ، داده های بیان ژن ، شبکه برهمکنش