بررسی خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه هایPseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی بادام در استان خراسان رضوی با استفاده از BOX-PCR

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 107

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_RPPM-3-1_001

تاریخ نمایه سازی: 24 بهمن 1402

چکیده مقاله:

شانکر باکتریایی که بوسیله پاتوار­های Pseudomonas syringae Van Hallایجاد می­شود یکی از مشکلات جدی باغ­های درختان میوه هسته­دار می­باشد. در این تحقیق طی سال­های ۱۳۹۱-۱۳۹۰ نمونه های دارای علائم شانکر از باغات بادام در استان خراسان رضوی جمع آوری شده و جداسازی باکتری انجام شد. عامل بیماری براساس آزمون­های گروه LOPAT و GATTa، (Pss)Pseudomonas syringae pv. Syringae  شناسایی شد. شانزده جدایه خالص ­سازی شده و مورد بررسی­های فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی قرار گرفتند. جدایه­ها براین اساس اختلافات جزئی نشان دادند. تشخیص مولکولی جدایه ها با واکنش زنجیره ای پلی­مراز با آغازگرهای اختصاصی D۲۱ و D۲۲ صورت گرفت. به منظور ارزیابی دامنه تنوع ژنتیکی جدایه­ها، از روش BOX-PCR استفاده شد. از ضریب تشابه جاکارد (Jaccard) برای تعیین تشابه جدایه­ها و از روش UPGMA و نرم افزار NTYSYS-pc برای آنالیز خوشه­ای استفاده شد. در آنالیز خوشه­ای داده­ها، جدایه­ها با آغازگر BOXA۱R در سطح تشابه ۶۸ درصد، در ۳ گروه قرار گرفتند. نتایج، بیانگر تنوع ژنتیکی جدایه­های عامل بیماری شانکر درختان بادام در استان خراسان رضوی است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

حمیده احسنی

دانش آموخته گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

سعید نصرالله نژاد

دانشیار گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

حشمت ا... رحیمیان

استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

اسفندیار ظهور

مربی پژوهش مرکز تحقیقات علوم کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی

میثم تقی نسب

مربی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abbasi V, Rahimian H and Tajick-Ghanbari A. ۲۰۱۳. Genetic variability ...
  • Alvarez A M. ۲۰۰۴. Integrated approaches for detection of plant ...
  • Arabi F, Nikravesh Z, Babaeezad V, Rezaeean V and Rahimian ...
  • Bahar M, Mochtahedi H and Akhiani A. ۱۹۸۲. Bacterial canker ...
  • Banapour A, Zakiee Z and Amani G. ۱۹۹۰. Isolation of ...
  • Bradbury J F. ۱۹۸۶. Guide to Plant Pathogenic Bacteria. CAB ...
  • Bultreys A and Kaluzna M. ۲۰۱۰. Bacterial cankers caused by ...
  • Dawson S L, Fry J C and Dancer B N. ...
  • Garden L, Shafik H, Belouin S, Broch R, Grimont F ...
  • Gilbert V, Legros F, Maraite H and Bultreys A. ۲۰۰۹. ...
  • Hildebrand D C, Schorth M N and Huisman O C. ...
  • Kaku H. ۲۰۰۳. Genetic diversity and infection mechanism of plant ...
  • Kang H P and Dunne W M. ۲۰۰۳. Stability of ...
  • Kennelly M M, Cazorla F M, Vicente A, Ramos C ...
  • Little E L, Bostock R M and Kirkpatric B C. ...
  • Lopez M M, Llop P, Olmos A, Mcro-Noales E, Cambra ...
  • Lopez M M, Rosello M and Palacio-Bielsa A. ۲۰۱۰. Diagnosis ...
  • Menard M, Sutra L, Luisetti J, Prunier J P and ...
  • Mohammadi M, Ghasemi A and Rahimian H. ۲۰۰۱. Phenotypic characterization ...
  • Mousivand M, Rahimian H and Shamsbakhsh M. ۲۰۰۹. Phenotypic and ...
  • Najafi Pour G and Taghavi S M. ۲۰۱۱. Comparison of ...
  • Palacio-Bielsa A, Cambra M A and López M M. ۲۰۰۹. ...
  • Palleroni N J. ۲۰۰۵. Genus Ӏ. Pseudomonas Migula ۱۸۹۴. pp. ...
  • Radmarker J W, Hoste B, Louws F J, Kersters K, ...
  • Samavatian H. ۲۰۰۶. Identification and distribution of bacterial disease agent ...
  • Schaad N W, Jones J B and Chun W. ۲۰۰۱. ...
  • Thomidis T, Tsipouridis C, Exadaktylou E and Drogoudi P. ۲۰۰۵. ...
  • Versalovic J, Koeuth T and Lupski J R. ۱۹۹۱. Distribution ...
  • Vicent J G and Roberts S J. ۲۰۰۷. Discrimination of ...
  • Vicent J G, Alves J P, Russell K and Roberts ...
  • نمایش کامل مراجع