Analysis of phylogenetic relationships of Potamogeton and Stuckenia (Potamogetonaceae) in Iran based on morphological, anatomical and molecular data

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 97

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJB-29-2_002

تاریخ نمایه سازی: 16 دی 1402

چکیده مقاله:

Potamogeton and Stuckenia comprise ۹۰ and ۷ respectively accepted species worldwide. Because of a wide range of intraspecific morphological variability including extensive phenotypic plasticity and ecological diversity, Potamogeton and Stuckenia are considered notoriously difficult taxa. A total of ۱۰۰ accessions representing ۱۱ taxa of Potamogeton and three of Stuckenia were collected across Iran. An initial screening based on allele lengths of highly variable cpDNA sequences allowed considering ۵۹ different accessions of one to eight individuals of each species for further morphological, anatomical, and molecular analyses. NrDNA ITS and three plastid regions (rbcL, matK, and trnH-psbA) were employed to reconstruct molecular phylogenies using maximum likelihood and Bayesian inferences. Analyses of nrDNA ITS sequences generated well-resolved tree topology than plastid data. There was some incongruence between nuclear data and concatenated chloroplast marker data (P=۰.۰۰۱). Additional testing of ISSR and SRAP markers for ۴۸ specimens showed higher resolution in species delimitation among linear leaved taxa, though not conclusive. Anatomical features could not separate Iranian species alone and should be used in combination with morphological characters that were highly informative. The results showed that Iranian Potamogeton species contain a rich gene pool due to the specific and diverse geographical conditions of Iran.

نویسندگان

Shabnam Abbasi

Department of Biology Education, Farhangian University, P.O. Box ۱۴۶۶۵-۸۸۹, Tehran, Iran

Saeed Afsharzadeh

Department of Plant and Animal Biology, Faculty of Biological Science and Technology, University of Isfahan, Isfahan, Iran

Mehri Dinarvand

Forests and Rangelands Research Division, Khuzestan Agricultural and Natural Resources Research and Education Center, Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Ahvaz, Iran

Ludwig Triest

Laboratory of Plant Biology and Nature Management (APNA), Department of Biology, Vrije Universiteit Brussel (VUB), Brussels, Belgium

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abbasi, S. & Afsharzadeh, S. ۲۰۱۶: An efficient and simple ...
  • Abbasi, S., Afsharzadeh, S., Saeidi, H. & Triest, L. ۲۰۱۶: ...
  • DOI: ۱۰.۱۳۷۱/journal.pone.۰۱۶۱۸۸۹Abbasi, S., Afsharzadeh, S., Dinarvand, M. & Wiegleb, G. ...
  • Ascherson, P. & Graebner, P. ۱۹۰۷: Potamogetonaceae. In. Das Pflanzenreich: ...
  • Aykurt, C. & Deniz, I.G. ۲۰۱۶: Anatomical differences of the ...
  • Blair, M.W., Panaud, O. & MC Couch, S.R. ۱۹۹۹: Inter ...
  • Cook, CDK. ۱۹۹۰: Aquatic Plant Book. SPB Academic Publishing, The ...
  • Cuenoud, P., Savolainen, V., Chatrov. L.W., Powell, M., Grayer, R.J. ...
  • Du, Z.Y., Qimike, A., Yang, C.F., Chen, J.M. & Wang, ...
  • Dinarvand, M. ۲۰۱۷: Families of Aquatic Plants. In: Assadi, M., ...
  • Dinarvand, M., Assadi, M. & Abbasi, S. ۲۰۲۲: A Taxonomic ...
  • Edgar, RC. ۲۰۰۴: MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy ...
  • DOI: ۱۰.۱۰۹۳/nar/gkh۳۴۰Fant, J.B., Kamau, E. & Preston, C.D. ۲۰۰۳: Chloroplast ...
  • Fehrer, J., Gemeinholzer, B., Chrtek, J.J. & Bra¨utigam, S. ۲۰۰۷: ...
  • Fernald, M.L. ۱۹۳۲: The linear- leaved North American species of ...
  • Hagström, J.O. ۱۹۱۶: Critical researches on the Potamogetons. Almqvist & ...
  • Haynes, R.R. ۱۹۷۴: A revision of North American Potamogeton subsection ...
  • Haynes, R.R., Les, D.H. & Kral, M. ۱۹۹۸: Two new ...
  • Hettiarachchi, P. & Triest, L. ۱۹۹۱: Isozyme polymorphism in the ...
  • Holub, J. ۱۹۹۷: Stuckenia Boerner ۱۹۱۲: the correct name for ...
  • Hollingsworth, P.M., Preston, C.D. & Gornall, R.J. ۱۹۹۸: Euploid and ...
  • Iida, S., Kosuge, K. & Kadono, Y. ۲۰۰۴: Molecular phylogeny ...
  • Ito, Y., Robledo, G.L, Iharlegui, L. & Tanaka, N. ۲۰۱۶: ...
  • Kaplan, Z. ۲۰۰۲: Phenotypic plasticity in Potamogeton (Potamogetonaceae). -Folia Geobotanica ...
  • Kaplan, Z. ۲۰۰۸: A taxonomic revision of Stuckenia (Potamogetonaceae) in ...
  • Kaplan, Z. & Fehrer, J. ۲۰۰۴: Evidence for the hybrid ...
  • Kaplan, Z., Jarolimova, V. & Fehrer, J. ۲۰۱۳: Revision of ...
  • Kimura, M. ۱۹۸۰: A simple method for estimating evolutionary rate ...
  • Kress, W.J. & Erickson, D.L. ۲۰۰۷: A two-locus global DNA ...
  • Kress, W.J., Wurdack, K.J., Zimmer, E.A., Weigt, L.A. & Janzen, ...
  • Leonard, J. ۱۹۸۸: Contribution à l’étude de la flore et ...
  • Les, D.H. ۱۹۸۳: Taxonomic implications of aneuploidy and polyploidy in ...
  • Les, D.H. & Haynes, R.R. ۱۹۹۵: Systematics of subclass Alismatidae. ...
  • Les, D.H. & Sheridan, D.J. ۱۹۹۰: Biochemical heterophylly and flavonoid ...
  • Levin, R.A., Wagner, W.L., Hoch, P.C., Nepokroeff, M., Pires, J.C., ...
  • Li, G. & Quiros, C.F. ۲۰۰۱: Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), ...
  • Lindqvist, C., De-Laet, J., Haynes, R.R., Aagesen, L., Keener, B.R. ...
  • Liu, Q.L., Ge, S., Tang, H.B., Zhang, X.L., Zhu, G.F. ...
  • Moallem, R. ۲۰۰۸: Investigation of intraspecies and interspecies diversity of ...
  • Meier, R., Shiyang, K., Vaidya, G. & Ng, P.K.L. ۲۰۰۶: ...
  • Nylander, J.A.A. ۲۰۰۸: MrModeltest ۲.۳. Program distributed by the author. ...
  • Ogden, E.C. ۱۹۴۳: The broad-leaved species of Potamogeton. -Rhodora ۴۵(۵۳۱): ...
  • Page, R.D. ۱۹۹۶: TreeView: an application to display phylogenetic trees ...
  • Computer Applications in the Biosciences ۱۲: ۳۵۷–۳۵۸ ...
  • Posada, D. & Buckley, T.R. ۲۰۰۴: Model selection and model ...
  • POWO. ۲۰۲۳: Plants of the World Online. Facilitated by the ...
  • Published on the Internet: http://www. plantsoftheworldonline.org/(Retrieved ۲۰ Novmber ۲۰۲۳)Raunkiaer, C. ...
  • Rieseberg, L.H. & Soltis, D.E. ۱۹۹۱: Phylogenetic consequences of cytoplasmic ...
  • Evolutionary Trends in Plants. ۵: ۶۵–۸۴Rohlf, F.J. ۲۰۰۰: NTSYS-pc Numerical ...
  • Ronquist, F. & Huelsenbeck, J.P. ۲۰۰۳: MrBayes ۳: Bayesian phylogenetic ...
  • Sack, L. & Scoffoni, C. ۲۰۱۳: Leaf venation: structure, function, ...
  • Sang, T., Crawford, D.J. & Stuessy, T.F. ۱۹۹۷: Chloroplast DNA ...
  • Schlichting, C.D. ۱۹۸۶: The evolution of phenotypic plasticity in plants. ...
  • Sun, K., Chen, X., Ma, R., Li, C., Wang, Q. ...
  • Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. ...
  • Tate, J.A. & Simpson, B. ۲۰۰۳: Paraphyly of Tarasa (Malvaceae) ...
  • Thompson, J.D., Higgins, D.G., Gibson, T.J. & Clustal, W. ۱۹۹۴: ...
  • Tur, N.M. ۱۹۸۲: Revision del genero Potamogeton L. en la ...
  • Vari, A., Toth, V.R. & Csontos, P. ۲۰۱۰: Comparing the ...
  • Wang, J.B., Wang, C., Shi, S.H. & Zhong, Y. ۲۰۰۰: ...
  • Wang, Q.D., Zhang, T. & Wang, J.B. ۲۰۰۷: Phylogenetic relationship ...
  • Wendelbo, P. ۱۹۷۱: Some distributional patterns within the flora Iranica, ...
  • Whittall, J.B., Hellquist, C.B., Schneider, E.L. & Hodges, S.A. ۲۰۰۴: ...
  • White, T.J., Bruns, T., Lee, S. & Taylor, J. ۱۹۹۰: ...
  • Wiegleb, G. ۱۹۸۸: Notes on pondweeds: outlines for a monographical ...
  • Woolson, R.F. ۲۰۰۷: Wilcoxon signed‐rank test. Wiley encyclopedia of clinical ...
  • Wiegleb, G. & Kaplan, Z. ۱۹۹۸: An account of the ...
  • Zhang, T., Wang, Q., Li, W., Cheng, Y. & Wang, ...
  • Zietkiewicz, E., Rafalski, A. & Labuda, D. ۱۹۹۴: Genome fingerprinting ...
  • Zohary, M. ۱۹۷۳: Geobotanical Foundations of the Middle East. Vol. ...
  • نمایش کامل مراجع