مطالعه ی بیوانفورماتیکی نیمرخ بیان ژن گیاهچه های آرابیدوپسیس به منظور شناسایی ژن های کلیدی و مسیرهای پاسخ دهنده به تنش گرما

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 166

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ISCAG04_011

تاریخ نمایه سازی: 20 بهمن 1401

چکیده مقاله:

تنش گرما بهعنوان یک چالش محیطی، رشد و نمو گیاهان را تهدید می کند. گیاهان مکانیسمهای مختلفی را برای پاسخ به تنشهای محیطی توسعه دادهاند. در پژوهش حاضر به منظور بررسی ژن های "بزرگ اثر" در پاسخ گیاه نسبت به تنش گرما، داده های مربوط به ریزآرایه آرابیدوپسیس از پایگاه داده ی GEO با شماره دسترسی GSE۶۳۱۲۸ دریافت و مورد ارزیابی قرار گرفت. پس از کنترل کیفیت و نرمال سازی داده ها تفاوت بیان و معنی داری با استفاده از بسته ی Limma صورت پذیرفت و تجزیه و تحلیل و نیز مصورسازی نتایج و داده های آنالیز تفاوت بیان انجام شد. بر اساس بررسی مسیرهای متابولیکی در پایگاه داده ی KEGG، تعداد ۳۱ مسیر معنی دار شد که انتقال هورمون گیاهی، بیوسنتز متابولیتهای ثانویه، مسیر گلیسروفسفولیپید و گلیسرولیپید، مسیر متابولیسم نشاسته و ساکارز و متابولیسم گالاکتوز از جمله مسیرهای شناسایی شده در ارتباط با تنش گرمایی بودند. در مجموع با توجه به تشریح عملکرد "ژنهای کلیدی" مربوط به مسیرانتقال سیگنالی هورمونهای گیاهی، میتوان نتیجه گرفت که اجزای دخیل در مسیر سیگنالینگ هورمون اکسین TIR۱) و (MP، گیرنده هسیتیدین کینازی مربوط به مسیر سایتوکنین (Wol) و همچنین بازدارنده SHY۲ (فعال شده توسط مسیر سیگنالی سایتوکنین)، به عنوان مهمترین اجزای کلیدی سیگنالینگ هورمونهای گیاهی در فعالسازی مکانیسمهای سازگاری به تنش گرما در آرابیدوپسیس مطرح هستند. برهم کنش این اجزای سیگنالی با یکدیگر سبب فعالسازی مسیرهای پائین دست و بروز پاسخهای تحمل به تنش گرما میشود که از آن جمله میتوان به تنظیم دقیق رشد مریستم انتهای ساقه و ریشه، رشد هیپوکوتیل، توسعه بافتهای آوندی و فعالسازی پروتئینهای شوک گرمایی اشاره کرد. از این رو یکی از برنامه های اصلاحی جهت تقویت تحمل به گرما میتواند از طریق دستکاری اجزای دخیل در این مسیرصورت گیرد.

نویسندگان

مرضیه کیانی ده کیان

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی،دانشکده کشاورزی، دانشگاه علومکشاورزی و منابع طبیعی خوزستان

هنگامه طاهری

استادیارگروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان

آیه سادات صدر

هیات علمی مسئول امور تحقیقات ژنتیک و اصلاح نژاد ماهیان، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور