ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

بررسی گستره ژنومی خانواده ژنی CIPK در گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (.Aeluropus littoralis L)

محل انتشار: فصلنامه تنش های محیطی در علوم زراعی، دوره: 15، شماره: 4
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 194

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1573340

شناسه ملی سند علمی:

JR_ESCS-15-4_011

تاریخ نمایه سازی: 5 دی 1401

چکیده مقاله:

شبکه سیگنالینگ CBL-CIPK یکی از مهم ترین سیستم های انتقال سیگنال در گیاهان بوده که سیگنال های کلسیم ناشی از تنش های محیطی مختلف را رمزگشایی می کند. پروتئین های متصل به یون کلسیم به عنوان مولکول های حسگر عمل نموده و با دریافت سیگنال های یون کلسیم سلولی، وظیفه هدایت پیام را به آبشارهای ژنی پایین دست بر عهده دارند. تحمل بالقوه تنش های غیرزنده خصوصا تنش شوری و قرابت آن به غلات، انگیزه اصلی بسیار از محققین برای مطالعه مکانیسم های مولکولی گونه هالوفیت Aeluropus littoralis است. در این تحقیق با توجه به در دسترس قرار گرفتن توالی ژنومی این گیاه، شناسایی این سیلیکو اعضای خانواده ژنی AlCIPK و ارزیابی پاسخ های بیانی آن ها در برابر تنش شوری مدنظر قرار گرفت. بر مبنای همولوژی با ژن های آرابیدوپسیس، ۲۰ ژن CIPK در ژنوم A. littoralis شناسایی شد. تجزیه وتحلیل جانمایی پروتئین ها نشان داد که این پروتئین ها در بخش های مختلف سلولی فعال هستند. درخت فیلوژنتیک بر مبنای توالی پروتئینی ۲۰ AlCIPK، ۲۶ AtCIPK و ۳۳ OsCIPK، نشان داد که ۷۹ CIPK موردبررسی از رابطه ارتولوژیکی قوی برخوردارند. آنالیز فیلوژنتیکی بر اساس تجزیه وتحلیل ساختار اگزون / اینترون، همه AlCIPK ها را به دو گروه کم-اینترون و غنی- اینترون تقسیم نمودند. الگوهای بیان متمایز اعضای خانواده ژنی AlCIPK انشقاق عملکردی و ساختاری این ژن ها را در طی تکامل تایید می کند. یافته های این بررسی ضمن ارائه برخی خصوصیات عملکردی خانواده ژنی سنسورهای کلسیم، اطلاعات پایه ای را برای تحقیقات آتی در مورد کارکرد بیولوژیکی این ژن ها فراهم می سازد.

کلیدواژه ها:

تنش شوری ، شبکه سیگنالینگ پروتئین کیناز تعامل کننده با CBL ، CBL-CIPK ، حسگر کلسیم

نویسندگان

مژده عرب

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران

حمید نجفی زرینی

دانشیار گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

قربانعلی نعمت زاده

استاد گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

سیدحمیدرضا هاشمی

استادیار گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Albrecht, V., Weinl, S., Blazevic, D., D'angelo, C., Batistic, O., ...
  • Armenteros, J.J.A., Tsirigos, K.D., Sønderby, C.K., Petersen, T.N., Winther, O., ...
  • Bailey, T.L., Boden, M., Buske, F.A., Frith, M., Grant, C.E., ...
  • Barhoumi, Z., Djebali, W., Smaoui, A., Chaïbi, W., Abdelly, C., ...
  • Ben-Saad, R., Ben-Ramdhan, W., Zouari, N., Azaza, J., Mieulet, D., ...
  • Bowe, L.M., Coat, G., Depamphilis, C.W., ۲۰۰۰. Phylogeny of seed ...
  • Dodd, A.N., Kudla, J., Sanders, D., ۲۰۱۰. The language of ...
  • El-Gebali, S., Mistry, J., Bateman, A., Eddy, S.R., Luciani, A., ...
  • Evrard, A., ۲۰۱۳. Cell type-specific transcriptional responses of plants to ...
  • Fatemi, F., Hashemi-Petroudi, S.H., Nematzadeh, G., Askari, H., Abdollahi, M.R., ...
  • Felsenstein, J., ۱۹۸۵. Confidence limits on phylogenies: an approach using ...
  • Gasteiger, E., Hoogland, C., Gattiker, A., Wilkins, M.R., Appel, R.D., ...
  • Hall, T., Biosciences, I., Carlsbad, C., ۲۰۱۱. BioEdit: an important ...
  • Hashemi-Petroudi, S., Nematzadeh, G., Mohammadi, S., Kuhlmann, M., ۲۰۲۰. Expression ...
  • Hashemi-Petroudi, S.H., Mohammadi, S., ۲۰۲۰. Identification of the ERF gene ...
  • Hashemi-Petroudi, S.H., Nematzadeh, G., Kuhlmann, M., ۲۰۱۹. Identification and analysis ...
  • Hashemi, S.H., Arab, M., Dolatabadi, B., Kuo, Y.-T., Baez, M.A., ...
  • Hu, B., Jin, J., Guo, A.-Y., Zhang, H., Luo, J., ...
  • Hu, W., Xia, Z., Yan, Y., Ding, Z., Tie, W., ...
  • Hulo, N., Bairoch, A., Bulliard, V., Cerutti, L., De Castro, ...
  • Jalili, M.M., Haddad, M.A., Housaindokht, M.R., ۲۰۱۹. Biocomputational investigations of ...
  • Ji, H., Pardo, J.M., Batelli, G., Van Oosten, M.J., Bressan, ...
  • Jones, P., Binns, D., Chang, H.-Y., Fraser, M., Li, W., ...
  • Kim, B.G., Waadt, R., Cheong, Y.H., Pandey, G.K., Dominguez‐Solis, J.R., ...
  • Kolukisaoglu, Ü., Weinl, S., Blazevic, D., Batistic, O., Kudla, J., ...
  • Letunic, I., Bork, P., ۲۰۱۸. ۲۰ years of the SMART ...
  • Li, J., Jiang, M.-M., Ren, L., Liu, Y., Chen, H.-Y., ...
  • Ma, X., Gai, W.-X., Qiao, Y.-M., Ali, M., Wei, A.-M., ...
  • Ma, X., Li, Q.-H., Yu, Y.-N., Qiao, Y.-M., Gong, Z.-H., ...
  • Mao, D., Chen, C., ۲۰۱۲. Colinearity and similar expression pattern ...
  • Mo, C., Wan, S., Xia, Y., Ren, N., Zhou, Y., ...
  • Mohanta, T.K., Kumar, P., Bae, H., ۲۰۱۷. Genomics and evolutionary ...
  • Monihan, S.M., Magness, C.A., Yadegari, R., Smith, S.E., Schumaker, K.S., ...
  • Nuruzzaman, M., Manimekalai, R., Sharoni, A.M., Satoh, K., Kondoh, H., ...
  • Pandey, G.K., Kanwar, P., Singh, A., Steinhorst, L., Pandey, A., ...
  • Podell, S., Gribskov, M., ۲۰۰۴. Predicting N-terminal myristoylation sites in ...
  • Scherf, U., Ross, D.T., Waltham, M., Smith, L.H., Lee, J.K., ...
  • Shi, J., Kim, K.-N., Ritz, O., Albrecht, V., Gupta, R., ...
  • Sigrist, C.J., De Castro, E., Cerutti, L., Cuche, B.A., Hulo, ...
  • Su, W., Ren, Y., Wang, D., Huang, L., Fu, X., ...
  • Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A., Kumar, S., ...
  • Yang, Y., Zhang, C., Tang, R.-J., Xu, H.-X., Lan, W.-Z., ...
  • Yin, X., Wang, Q., Chen, Q., Xiang, N., Yang, Y., ...
  • Younesi-Melerdi, E., Nematzadeh, G., Pakdin-Parizi, A., ۲۰۲۰. Expression analysis of ...
  • Yu, Q., An, L., Li, W., ۲۰۱۴. The CBL–CIPK network ...
  • Zhang, H., Yang, B., Liu, W.-Z., Li, H., Wang, L., ...
  • Zhao, J., Yu, A., Du, Y., Wang, G., Li, Y., ...
    • نمایش کامل مراجع