ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های Freesia hybrida با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR
محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 14، شماره: 1
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 285
فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-14-1_005
تاریخ نمایه سازی: 30 فروردین 1401
چکیده مقاله:
هدف: هدف از پژوهش حاضر، ارزیابی تنوع ژنتیکی ۲۳ ژنوتیپ گیاه زینتی فریزیا (Freesia hybrida) شامل شش ژنوتیپ والدینی و ۱۷ دورگF۱ حاصل از تلاقی آنها، با استفاده از ۱۰ آغازگر ISSR به منظور بهرهبرداری از این تنوع در برنامههای بهنژادی این گیاه بودهاست. مواد و روش ها: پس از استخراج DNA از برگهای تازه و تکثیر نواحی نشانگری در دستگاه PCR و تفکیک قطعات نشانگری بر روی ژل الکتروفورز، نوارها نمرهدهی شدند و بر اساس ماتریس دادههای صفر و یک، پارامترهای نشانگری شامل تعداد لوکوسهای چند شکل، محتوای اطلاعات چندشکلی، نسبت چندگانه موثر، شاخص قدرت تفکیک، شاخص نشانگری و شاخصهای تنوع ژنتیکی شامل تعداد مشاهده شده و تعداد موثر آللها، شاخص تنوع ژنی نی و شاخص اطلاعات شانون مبتنی بر دادههای نشانگر ISSR محاسبه شدند. تجزیه به مولفههای اصلی بر اساس ضریب تشابه جاکارد با الگوریتم UPGMA و تجزیه خوشهای با استفاده از از ضرایب دایس به روش گروهبندی وارد انجام شد. نتایج: از مجموع ۱۱۰ مکان ژنی تکثیر یافته برای ۱۰ نشانگر ISSR، متوسط درصد چندشکلی برابر با ۷/۹۴ درصد در میان ژنوتیپهای تحت بررسی برآورد شد. نشانگر IS-HB۱۱ بیشترین تعداد مکان ژنی چندشکل (۱۲)، نسبت چندگانه موثر (۳۹/۷)، شاخص قدرت تفکیک (۸۳/۷) و شاخص نشانگری (۶۷/۲) را به خود اختصاص داد. تجزیه خوشهای، ژنوتیپها را به چهار گروه تفکیک و تجزیه به مولفههای اصلی درستی این گروهبندی را تائید کرد. نتیجه گیری: اندازه نسبتا بالای شاخص محتوای اطلاعات چندشکلی (۳۶۸/۰)، نشان داد که نشانگرهای بهکار رفته در این پژوهش از اطلاعات ژنتیکی مناسب از لحاظ تعداد آللهای شناسایی شده و نیز توزیع فراوانی مناسب در ژنوم گیاه فریزیا برخوردار بوده و کارایی بالای خود را در تفکیک ژنوتیپها نشان دادند. همچنین بر اساس شاخصهای تنوع ژنی برآورد شده، بین والدین و دورگهای حاصل از تلاقی آنها اختلاف معنی داری مشاهده نشد. با وجود این، سطح تنوع ژنتیکی موجود قابل قبول بوده و میتوان از این تنوع در برنامههای بهنژادی فریزیا بهرهبرداری نمود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
زهرا عربی
گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
علاءالدین کردنائیج
گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران
محمدحسین عظیمی
گروه ژنتیک و به نژادی، موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، محلات، ایران.
مریم کریمی علویجه
استاد، پژوهشکده گل و گیاهان زینتی، موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، محلات،
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :