ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های Freesia hybrida با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 250

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-14-1_005

تاریخ نمایه سازی: 30 فروردین 1401

چکیده مقاله:

هدف: هدف از پژوهش حاضر، ارزیابی تنوع ژنتیکی ۲۳ ژنوتیپ گیاه زینتی فریزیا (Freesia hybrida) شامل شش ژنوتیپ والدینی و ۱۷ دورگF۱   حاصل از تلاقی آنها، با استفاده از ۱۰ آغازگر ISSR به منظور بهره­برداری از این تنوع در برنامه­های به­نژادی این گیاه بوده­است. مواد و روش ها: پس از استخراج DNA از برگ­های تازه و تکثیر نواحی نشانگری در دستگاه PCR و تفکیک قطعات نشانگری بر روی ژل الکتروفورز، نوارها نمره­دهی شدند و بر اساس ماتریس داده­های صفر و یک، پارامترهای نشانگری شامل تعداد لوکوس­های چند شکل، محتوای اطلاعات چندشکلی، نسبت چندگانه موثر، شاخص قدرت تفکیک، شاخص نشانگری و شاخص­های تنوع ژنتیکی شامل تعداد مشاهده شده و تعداد موثر آلل­ها، شاخص تنوع ژنی نی و شاخص اطلاعات شانون مبتنی بر داده­های نشانگر ISSR محاسبه شدند. تجزیه به مولفه­های اصلی بر اساس ضریب تشابه جاکارد با الگوریتم UPGMA و تجزیه خوشه­ای با استفاده از از ضرایب دایس به روش گروه­بندی وارد انجام شد. نتایج: از مجموع ۱۱۰ مکان ژنی تکثیر یافته برای ۱۰ نشانگر ISSR، متوسط درصد چندشکلی برابر با ۷/۹۴ درصد در میان ژنوتیپ­های تحت بررسی برآورد شد. نشانگر IS-HB۱۱ بیشترین تعداد مکان ژنی چندشکل (۱۲)، نسبت چندگانه موثر (۳۹/۷)، شاخص قدرت تفکیک (۸۳/۷) و شاخص نشانگری (۶۷/۲) را به خود اختصاص داد. تجزیه خوشه­ای، ژنوتیپ­ها را به چهار گروه تفکیک و تجزیه به مولفه­های اصلی درستی این گروه­بندی را تائید کرد. نتیجه گیری: اندازه نسبتا بالای شاخص محتوای اطلاعات چندشکلی (۳۶۸/۰)، نشان داد که نشانگرهای به­کار رفته در این پژوهش از اطلاعات ژنتیکی مناسب از لحاظ  تعداد آلل­های شناسایی شده و نیز توزیع فراوانی مناسب در ژنوم گیاه فریزیا برخوردار بوده و کارایی بالای خود را در تفکیک ژنوتیپ­ها نشان دادند. همچنین بر اساس شاخص­های تنوع ژنی برآورد شده، بین والدین و دورگ­های حاصل از تلاقی آن­ها اختلاف معنی داری مشاهده نشد. با وجود این، سطح تنوع ژنتیکی موجود قابل قبول بوده و می­توان از این تنوع در برنامه­های به­نژادی فریزیا بهره­برداری نمود.

کلیدواژه ها:

تجزیه به مولفه های اصلی ، تجزیه خوشه ای ، تنوع ژنی ، شاخص نشانگری

نویسندگان

زهرا عربی

گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران

علاءالدین کردنائیج

گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شاهد، تهران، ایران

محمدحسین عظیمی

گروه ژنتیک و به نژادی، موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، محلات، ایران.

مریم کریمی علویجه

استاد، پژوهشکده گل و گیاهان زینتی، موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، محلات،

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • عطاری سیده زینب، شور محمود، قربانزاده نقاب محمود، تهرانی فر ...
  • عرفانی ملیحه، محب الدینی مهدی، قنبری علیرضا، صباغ نیا ناصر ...
  • قنبری همدانی سمیه، عصری یونس، مهرگان ایرج (۱۳۹۹) مطالعه تنوع ...
  • محمدی سید ابوالقاسم (۱۳۸۵) تجزیه و تحلیل داده­های مولکولی از ...
  • مومنی حسن، شیران بهروز، خدامباشی محمود، چغامیرزایی کیانوش (۱۳۹۲) بررسی ...
  • Anderson NO (۲۰۰۷) Flower breeding and genetics. Springer, the Netherlands, ...
  • Attari SZ, Shoor M, Ghorbanzadeh Neghab M, et al. (۲۰۱۶) ...
  • Botstein D, White RL, Skalnick MH, Davies RW (۱۹۸۰) Construction ...
  • Bryan JE (۲۰۰۲) Bulbs. Timber Press. Portland, Oregon, USA. ۵۲۴ ...
  • Chesnokov YV, Artemyeva AM (۲۰۱۵) Evaluation of the measure of ...
  • Debener T (۲۰۱۲) Molecular markers for ornamental plant genetics, genomics ...
  • Doyle JJ, Doyle JL (۱۹۹۰) Isolation of plant DNA from ...
  • Erfani M, Mohebodini M, Ghanbari A, Sabbaghnia N (۲۰۱۷) Investigating ...
  • Ghanbari Hamedani S, Asri Y, Mehregan I (۲۰۲۰) Genetic diversity ...
  • Jamali M, Ghanbari A, Estaji A et al. (۲۰۱۹) Genetic ...
  • Kayis SA, Hakki EE, Pinarkara E (۲۰۱۰) Comparison of effectiveness ...
  • Konopiński MK (۲۰۲۰) Shannon diversity index: a call to replace ...
  • Lewontin RC (۱۹۷۲) The apportionment of human diversity. Evol Biol ...
  • Ma X, Zhang XQ, Zhou YH et al. (۲۰۰۸) Assessing ...
  • Mohammadi SA (۲۰۰۶) Analysis of molecular data from the perspective ...
  • Momeni H, Shiran B, Khodambashi M, Choghamirzaie, K (۲۰۱۳) Evaluation ...
  • Nadeem MA, Nawaz MA, Shahid MQ et al. (۲۰۱۸) DNA ...
  • Ng W, Tan SG (۲۰۱۵) Inter-simple sequence repeat (ISSR) markers: ...
  • Nie M (۱۹۷۸) Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a ...
  • Reddy MP, Sarla N, Siddiq EA (۲۰۰۲) Inter simple sequence ...
  • Roldán-Ruiz I, Dendauw J, Van Bockstaele E et al. (۲۰۰۰) ...
  • Rout GR and Mohapatra A (۲۰۰۶) Use of molecular markers ...
  • Soengas P, Velasco P, Padilla G et al. (۲۰۰۶) Genetic ...
  • Talas Ogras T, Koban E, Metin K et al. (۲۰۱۷) ...
  • Vijayan K (۲۰۰۵) Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and ...
  • Ward JH (۱۹۶۳) Hierarchical Grouping to Optimize an Objective Function. J ...
  • Watanabe KN, Watanabe JA (۲۰۰۰) Genetic diversity and molecular genetics ...
  • Zhang LJ, Dai SL ۲۰۱۰ Genetic variation within and among ...
  • Zietkiewicz E, Rafalski A, Labuda D (۱۹۹۴) Genome fingerprinting by ...
  • نمایش کامل مراجع