بررسی اثر ضد ویروسی کارواکرول در مهار ویروس کرونا به روش مولکولار داکینگ

مقدمه: در اواخر ۲۰۱۹ ،یک بیماری ویروسی جدید، با نام کووید-۱۹،ناشی از کروناویروس CoV-SARS ۲ از چین آغاز و خیلی زود به یک پاندمی تبدیل شد. کووید-۱۹ عامل تهدیدکننده سلامت انسانها و مسبب خسارات جانی و مالی جوامع بشری است. لذا محققین در تلاش برای شناسایی بهتر و کنترل سریعتر آن هستند. پروتئاز اصلی COVID-۱۹ یا mpro یک آنزیم کلیدی برای تکثیر کووید۱۹ است. هدف از این مطالعه، بررسی اثر ضد ویروسی ترکیب گیاهی کارواکرول در مهار آنزیم mpro به روش بیوانفورماتیک می باشد.روش ها: در این پژوهش، در ابتدا ساختار ترکیب شیمیایی در نرم افزار هایپرکم ترسیم گردید و بهینه سازی انرژی با همان نرم افزار انجام گرفت، به منظور مطالعات داکینگ و مشاهده جزئیات اتصال و تجزیه و تحلیل نهایی، به ترتیب از نرم افزارهای اتوداک و دیسکاوری استفاده شد.یافته ها: ترکیب مورد مطالعه قادر به اتصال به جایگاه فعال آنزیم با سطح انرژی اتصال -۳,۲۰ kcal/mol می باشد و پیوند هیدروژنی با اسیدآمینه کلیدی Gln۱۸۹ برقرار می کند. برهم کنش با این اسید آمینه در جایگاه فعال با مولکول کوکریستال هم مشاهده شد.نتیجه گیری: با توجه به این که ترکیب مورد مطالعه در بررسی داکینگ، قادر به اتصال به Active site آنزیم هست می توان برای بررسی های تکمیلی اثر این ترکیب را در شرایط آزمایشگاهی و حیوانی مورد آنالیز قرار داد.

کلیدواژه ها:

کووید۱۹ ، کارواکرول ، مهارکننده ، داکینگ مولکولی ، آنزیم mpro ، بررسی بیوانفورماتیکی