فراواکاوی داده های ریزآرایه به همراه شناسایی فاکتورهای رونویسی موثر در پاسخ به تنش شوری جو از طریق آنالیز پروموتر

جو (.Hordeum Vulgar L) یکی از غلات عمده در سراسر جهان است. با این وجود رشد و بهره وری آن به دلیل تنش هایغیرزیستی مختلف، به ویژه تنش شوری، تهدید میشود. آشکارسازی نحوه سازگاری جو با تنش شوری در سطح رونویسیبسیار مهم است. این میتواند اطلاعات ارزشمندی در مورد افزایش عملکرد تحمل تنش شوری جو از طریق فناوری هایمهندسی ژنتیک ارائه دهد. این مطالعه بر روی فراواکاوی داده های ریزآرایه مربوط به تنش شوری برای شناسایی عواملرونویسی کلیدی و مسیرهای پاسخگو به تنش متمرکز شده است. بر اساس فراواکاوی، در مجموع ۳۷۱ ژن افتراق بیان (DEG)در بین شرایط کنترل و تنش شناسایی شد. نتایج هستی شناسی ژن (GO) نشان داد که DEG ها در فرآیندهای کاهشاکسیداسیون، فتوسنتز، پاسخ تنش غیرزیستی و ABA به طور قابل توجهی غنی شدهاند. علاوه بر این، ما در مناطق بالادستDEG ها موتیف های DNA را جستجو کردیم که در نهایت توانستیم ۱۱ توالی حفاظت شده را شناسایی کنیم. بر اساس نتایجواکاوی موتیف ها، به نظر می رسد C۲H۲ zinc finger ، WRKY ، MYB و AP۲/ERF فاکتورهای رونویسی اصلی هستند کهاحتمالا در کنترل رونویسی تنش شوری در جو نقش دارند.

کلیدواژه ها:

فراواکاوی ، فاکتور رونویسی ، تنش شوری ، جو ، داده های ترنسکریپتوم