ارزیابی ژنتیکی صفات وزن بدن در گاوهای گوشتی سیمنتال آمریکا با استفاده از روش تک مرحله ای بهترین پیش بینی خطی نااریب ژنومی (ssGBLUP)

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 514

فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_RAP-12-33_016

تاریخ نمایه سازی: 20 آذر 1400

چکیده مقاله:

     در این تحقیق به ­منظور برآورد پارامترهای ژنتیکی و روند ژنتیکی صفات وزن بدن از اطلاعات ۱۹۱۷۱ راس گاو گوشتی نژاد سیمنتال آمریکا شامل ۸۷۵۸ راس گاو نر و ۱۰۴۱۳ راس گاو ماده مربوط به سال­های ۱۳۷۸ تا ۱۳۹۴ استفاده شد. از تعداد ۵۱۹۹، ۱۰۹۲۶، ۷۳۶۲ و ۵۶۳۶ راس گاو ژنوتیپ شده بر اساس نشانگرهای SNP به ­ترتیب برای ارزیابی ژنتیکی صفات وزن تولد، وزن شیرگیری، وزن یک سالگی و افزایش وزن پس از شیر گیری تا یک سالگی استفاده شد. پارامترهای ژنتیکی با استفاده از مدل حیوانی تک صفتی و دو صفتی و به کمک نرم افزار BLUPf۹۰  برآورد شد. در آنالیز تک صفتی وراثت ­پذیری وزن تولد، وزن شیرگیری، وزن یک سالگی و افزایش وزن پس از شیرگیری تا یک سالگی به ­ترتیب ۰/۰۲ ± ۰/۳۸ ، ۰/۰۱ ± ۰/۲۴، ۰/۰۱ ± ۰/۳۵ و ۰/۰۲ ± ۰/۲۲ برآورد شد. همبستگی ژنتیکی وزن تولد با افزایش وزن پس از شیرگیری تا یک سالگی ۰/۳۱ به دست آمد. بیشترین صحت پیش ­بینی ژنومی مریوط به وزن شیرگیری (۰/۶۸) و کمترین آن مربوط به افزایش وزن پس از شیرگیری تا یکسالگی (۰/۲۷) برآورد شد. روند ژنتیکی وزن تولد، وزن شیرگیری، وزن یک سالگی و افزایش وزن پس از شیرگیری تا یک سالگی به­ ترتیب ۰/۱۳، ۰/۲۸، ۳/۴۳ و ۰/۰۵ کیلوگرم در سال بدست آمد. علاوه ­براین، نوسانات اندکی در روند ژنتیکی تمامی صفات به­ ویژه وزن شیرگیری و وزن یکسالگی طی سال ­های مورد بررسی مشاهده شد که نشان از وجود اهداف و معیار انتخاب مشخص در هر یک از این صفات می باشد. همچنین، در مجموع سهQTL  با اثر عمده روی کروموزوم ­های شش در موقعیت ۳۷ میلیون باز، کروموزوم هفت در موقعیت ۹۰ میلیون باز و کروموزوم چهارده در موقعیت ۲۲ میلیون باز شناسایی شد. با توجه به همبستگی مطلوب صفات وزن بدن، برنامه اصلاح نژادی بایستی بر اساس انتخاب همزمان برای صفات مذکور از طریق یک شاخص انتخاب صورت گیرد.

نویسندگان

جلیل شجاع

university of Tabriz

صادق علیجانی

university of Tabriz

سید عباس رافت

university of Tabriz

جک دکرز

Iowa state university

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Aguilar, I., I. Misztal, D.L. Johnson, A. Legarra and S. ...
  • Akanno, E.C., L. Chen, K. Mohammed, A. Ismail, J. Crowley, ...
  • Boldt R.J., S.E. Speidel, M.G. Thomas and R. Mark Enns. ...
  • Cheng, H., D.J. Garrick, and R.L. Fernando. JWAS: Julia implementation ...
  • Daetwyler, H., K. Kemper, J. Van der Werf and B. ...
  • Dorostkar, M., S.A. Rafat, J. Shodja and N. Pirany. ۲۰۱۰. ...
  • Fernando, R.L., J.C. Dekkers and D.J. Garrick. ۲۰۱۴. A class ...
  • Freebern, E., D.J.A. Santos, L. Fang, J. Jiang, K.L. Parker ...
  • Garrick, D.J., J.F. Taylor and R.L. Fernando. ۲۰۰۹. Deregressing estimated ...
  • Habier, D., R.L Fernando and J.C. Dekkers. ۲۰۰۹. Genomic selection ...
  • Hanford, K.J., L.D. Van Vleck, and G.D. Snowder. ۲۰۰۵. Estimates ...
  • Hanford, K.J., L.D. Van Vleck and G.D. Snowder. ۲۰۰۶. Estimates ...
  • Hansen, L.B., A.E. Freeman and P.J. Berger. ۱۹۸۳. Yield and ...
  • Hayes, B.J., P.J. Bowman, A. Chamberlain and M. Goddard. ۲۰۰۹. ...
  • Hieber, J.K., R.L. Endecott, J.A. Boles and J.M. Thomson. ۲۰۲۱. ...
  • Irvine Lopez, B., K.G. Santiago, K. Seo, T. Jeong, J.E. ...
  • Jiang, J., J.B. Cole, E. Freebern, Y. Da, P.M. VanRaden ...
  • Karim, L., H. Takeda, L. Lin, T. Druet, J.A. Arias, ...
  • Khorshidi, R., M.D. MacNeil, D.P. Hays, M.K. Abo-Ismail, J.J. Crowley, ...
  • Lee, J., H. Cheng, D. Garrick. B. Golden, J.C.M Dekkers, ...
  • Legarra, A., I. Aguilar and I. Misztal. ۲۰۰۹. A relationship ...
  • Meyer, K., B. Tier and A. Swan. ۲۰۱۸. Estimates of ...
  • Meuwissen, T., B. Hayes and M. Goddard. ۲۰۰۱. Prediction of ...
  • Miller, S. ۲۰۱۰. Genetic improvement of beef cattle through opportunities ...
  • Misztal, I., A. Legarra and I. Aguilar. ۲۰۱۴. Using recursion ...
  • Naderi, Y. ۲۰۱۸. The importance of genetic relationships and phenotypic ...
  • Nejati-Javaremi, A., C. Smith and J. Gibson. ۱۹۹۷. Effect of ...
  • Nishimura, S., T. Watanabe, K. Mizoshita, K. Tatsuda, T. Fujita, ...
  • Pausch, H., I.M. MacLeod, R. Fries, R. Emmerling, P.J. Bowman, ...
  • Pérez-Cabal, M.A., A.I. Vazquez, D. Gianola, G.J.M. Rosa and K.A. ...
  • Phocas, F. and D. Laloe. ۲۰۰۴. Genetic parameters for birth ...
  • Purcell, S., B. Neale, K. Todd-Brown, L. Thomas, M.A. Ferreira, ...
  • Rashidi, A. and H. Akhshi. ۲۰۰۷. Estimation of genetic and ...
  • Saatchi, M., M.C. McClure, S.D. McKay, M.M. Rolf, J. Kim, ...
  • Saatchi, M, R.D. Schnabel, J.F. Taylor and D.J. Garrick. ۲۰۱۴. ...
  • Saheb Alam, H., M. Gholizadeh, H. Hafezian and A. Farhadi. ...
  • Sullivan, P.G., J.W. Wilton, S.P. Miller and L.R. Banks. ۱۹۹۹. ...
  • Torres-Vázquez, J.A., J.H.J van der Werf and S.A. Clark. ۲۰۱۸. ...
  • VanRaden, P.M. ۲۰۰۸. Efficient Methods to Compute Genomic Predictions. Journal ...
  • VanRaden, P.M., C.P. Van Tassell, G.R. Wiggans, T.S. Sonstegard, R.D. ...
  • Visscher, P. and C. Haley. ۱۹۹۸. Strategies for marker-assisted selection ...
  • Wiggans, G.R., T.S. Sonstegard, P.M. VanRaden, L.K. Matukumalli, R.D. Schnabel, ...
  • Zheng, X., Z. Ju, J. Wang, Q. Li, J. Huang, ...
  • نمایش کامل مراجع