بررسی تنوع ژنتیکی در ارقام برنج (Oryza sativa L.) موجود در ایران با استفاده از نشانگرهای SSR

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 393

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-8-20_012

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400

چکیده مقاله:

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در ژنوتیپ های برنج موجود در ایران، تنوع موجود در ۳۸ رقم برنج با استفاده از ۱۴ نشانگر SSR بررسی شد. آزمایش در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی در مزرعه تحقیقاتی واقع در شهرستان آزادشهر در سال ۱۳۹۲ انجام شد نمونه های گیاهی در مرحله پنجه زنی در اوایل صبح از ژنوتیپ های مختلف جمع­آوری شد. DNA  از نمونه های گیاهی استخراج و جداسازی با استفاده ازژل پلی آکریل آمید بر روی آنها انجام شد. فواصل ژنتیکی زیاد بین ارقام تنوع بالایی را بین ژنوتیپ های برنج ایرانی نشان داد. تجزیه به مولفه های اصلی ۶۲ درصد از تغییرات را توجیه کرد. بیشترین فراوانی آللی مربوط به مکان RM۳۰۲ (۶۲/۰) و کمترین فراوانی آللی مربوط به مکان ژنی RM۲۶۲ (۲۱/۰) می باشد. میانگین فراوانی آللی ۳۹/۰ بود. بیشترین محتوای اطلاعات چند شکل در RM۲۶۲ (۸۱/۰) و کمترین در RM۲۴۱ (۳۳/۰) ثبت شد و میانگین PIC، ۵۱/۰ بود. میانگین شاخص شانون ۳۳/۰ بود از میان نشانگرهای ریزماهواره به­کار رفته در این مطالعه نشانگرهای RM۳۴۱، RM۲۵۵، RM۱۴۲ و RM۲۶۲ قدرت تمایز بالایی داشتند. بیشترین تعداد نشانگر مثبت در صفت ارتفاع دیده شد. تجزیه خوشه ای به روش وارد ژنوتیپ ها را در سه گروه قرار داد. در کل می توان گفت ارقام موجود در ایران از تنوع بالایی برخوردارند و می توان در برنامه های به نژادی از تنوع موجود در آنها بهره جست. نشانگرهای به­کار رفته در این مطالعه به دلیل رنج بالای تنوع در آنها، در مطالعات بعدی و یا کارهای اصلاحی سودمند خواهد بود.

نویسندگان

مهرنسا قره خانی

دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

سعید نواب پور

دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

حسین صبوری

دانشگاه گنبدکاووس

ساناز رمضانپور

دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abraham, A., M.R. Naqvi, M. Dexterity and A. Moradi Mirage. ...
  • Arpn Journal of Agriculture and Biological Science, ۴: ۶۰-۶۴ ...
  • Asian Journal of Contemporary Sciences, ۲: ۳۵-۴۴ ...
  • Chakravarthi, B.K. and R. Naravaneni. ۲۰۰۶. SSR marker based DNA ...
  • Choudhury, B., M. Latifkhan and S. Dayanandan. ۲۰۱۳. Genetic structure ...
  • Das, H.K., A. Singhand and S. Datti. ۲۰۱۳. Phylogenetic relationship ...
  • Doku, H.A., E.Y. Danquah, A.N. Among, K. Nyalemegbe and H.M. ...
  • Gorbani, H.R., H.A. Samiezadelahijani, B. Rabiei and M. Allahgolipour. ۲۰۱۱. ...
  • Jamal, I.H., A. Bari, S. Khan and I. Zada. ۲۰۰۹. ...
  • Kamali, N., S. Navabpour, H. Soltanloo and M. Kalateh. ۲۰۱۵. ...
  • Navabpour, S. and R. Haddad. ۲۰۱۰. Evaluation of glutamine syntetase ...
  • Rabey, H., K.H. Salem and M. Mattar. ۲۰۱۳. The genetic ...
  • Sabouri, H., A. Sabouri, M. Nahavi, A.R. Dadras and M. ...
  • Sambrook, J. and D. Russel. ۲۰۰۱. Molecular cloning, (۱): ۱۰۳۷ ...
  • Seetharam, K., S. Thirumeni and K. Paramasivam. ۲۰۰۹. Estimatin of ...
  • Shaha, S.M., S.A. Naveed and M. Arif. ۲۰۱۳. Genetic diversity ...
  • Skaria, R., S. Sen and P. Muneer. ۲۰۱۱. Analysis of ...
  • Tavvalla, R. ۲۰۱۳. Haplotype diversity in the QTL on chromosome ...
  • Vanniarajan, C., K.K. Vinod and A. Pereira. ۲۰۱۲. Molecular evaluation ...
  • Weising, K., H. Nybom, K. Wolff and G. Kahl. ۲۰۰۵. ...
  • www. gramane.org ...
  • Zeng, L., T.R. Kwon, X. Liu, C. Wilson, C.M. Grieve ...
  • نمایش کامل مراجع