مکان یابی ژن های کمی کنترل کننده متابولیت ها در گیاهچه های برنج تحت تنش شوری

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 277

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ESCS-13-4_019

تاریخ نمایه سازی: 23 خرداد 1400

چکیده مقاله:

برنج یکی از مهم ترین گیاهان زراعی است و شوری یک محدودیت عمده در توسعه کشت آن است. بهبود بخشیدن به تحمل به شوری در برنج از نظر ژنتیکی، یک مسئله بسیار مهم در برنامه های تولید برنج است. این پژوهش به منظور بررسی ۹۶ لاین F۸ حاصل از تلاقی رقم اهلمی طارم (مقاوم به تنش شوری) و رقم ندا (حساس به تنش شوری) به تنش شوری در دانشکده کشاورزی دانشگاه گنبد کاووس در سال ۱۳۹۳ به صورت هیدروپونیک انجام شد. نقشه پیوستگی مبتنی بر ۹۶ فرد F۸ با استفاده از ۳۰ نشانگر SSR و ۱۵ نشانگر ISSR تهیه شد که ۱۴۱۱.۳ سانتی مورگان از ژنوم برنج را پوشش داد. میانگین فاصله بین دو نشانگر مجاور ۱۵.۳۴ سانتی مورگان بود. برای درجه تحمل به شوری یک QTL روی کروموزوم ۷ ردیابی شد که توانست ۹.۳ درصد از تغییرات فنوتیپی صفت را توجیه کند. برای میزان نشاسته یک مکان ژنی روی کروموزوم ۴ شناسایی شد که دارای LOD برابر با ۲.۷۹۹ بود. اثر افزایشی برای این QTL برابر با ۶.۵۷۶ بود و ۱۲.۶ درصد از تغییرات فنوتیپی صفت را توجیه کرد. برای میزان فنل یک مکان ژنی روی کروموزوم ۷ ردیابی شد که ۱۵.۲ درصد از واریانس فنوتیپی صفت را توجیه کرد و به ترتیب دارای اثر افزایشی و LOD برابر با ۲.۷۲۸ و ۳.۴۳۸ بود. آلل های والد اهلمی طارم باعث افزایش این صفت شدند. برای میزان کلروفیل یک QTL روی کروموزوم ۵ ردیابی شد که LOD آن برابر با ۲.۰۲ بود. این QTL به ترتیب دارای اثر افزایشی و ضریب تبیین ۹.۷ و ۹.۲ بود بنابراین می توان QTL های شناسایی شده را بعد از تعیین اعتبار ژنوتیپ های برتر از نظر صفات بررسی شده برای برنامه های انتخاب به کمک نشانگر استفاده نمود.

نویسندگان

فهیمه حسینی راد

دانشجوی سابق زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه گنبد کاووس

عیسی جرجانی

گروه زیست شناسی دانشکده علوم پایه، فنی مهندسی دانشگاه گنبدکاووس

حسین صبوری

دانشیار دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس

ابراهیم غلامعلی پور علمداری

استادیار دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • An, Z.W., Xie, L.L., Cheng, H., Zhou, Y., Zhang, Q., ...
  • Ansari, R., Shereen, A., Flowers, T.J., Yeo, A. R., ۲۰۰۱. ...
  • Bao, J.S. Corke, H. Ping, H., Li-Huang, Z., ۲۰۰۳. Analysis ...
  • Bao, Y., Huang, L., Li, Y., Wang, M., Liang, Z., ...
  • Bates, L. S., Waldren, S. P., Teare, I. D., ۱۹۷۳. ...
  • DuNing, X., Lix, Y., Song, D., Yang, G., ۲۰۰۷. Temporal ...
  • Feng, Y. Cao, L.Y. Wu, W.M. Shen, X.H. Zhan, X.D. ...
  • Fukuda, A., Terao, T., ۲۰۱۵. QTLs for shoot and chlorophyll ...
  • Gregorio, G.B., ۱۹۹۷. Tagging salinity tolerance genes in rice using ...
  • Haq, T. U., Akhtar, J., Gorham, J., Khalid, M., ۲۰۰۸. ...
  • Kosambi, D.D., ۱۹۴۴. The estimation of map distances from recombination ...
  • Koyama, M. L., Levesley, A., Koebner, R. M. D., Flowers, ...
  • Kumar, V., Shiram, V., Jawali, N., Shitole, M. G., ۲۰۰۷. ...
  • Lee, S.Y., Ahn, J.H., Cha, Y.S., Yun, D.W., Lee, M.C., ...
  • Malik, C.P., Singh, M. B., ۱۹۸۰. Plant Enzymology and Histoenzymology. ...
  • Manly, K.F., Olson, J.M., ۱۹۹۹. Overview of QTL mapping software ...
  • McCouch, S. R., Cho, Y. G., Yano, M., Paul. E., ...
  • Nelson, J.C., ۱۹۹۷. QGENE: software for marker-based genomic analysis and ...
  • Rabiei, B., Mardani, K.H, Sabouri, H., Sabouri, A., ۲۰۱۴. The ...
  • Sabouri, H., ۲۰۰۸. Evaluation of genetic variety of Iranian rice ...
  • Sabouri, H., Sabouri, A., ۲۰۰۸. New evidence of QTLs attributed ...
  • Saghi Maroof, M.A., Biyaoshev, R.M., Yang, G. P., Zhang, Q., ...
  • Sayed, M.A., Schumann, H., Pillen, K., Naz, A.A., Leon, J., ...
  • Shahid-Masood, M., Seiji, Y., Shinwari, Z.K. Anwar, R., ۲۰۰۴. Mapping ...
  • Shannon, M.C., Gronwald, J.W., TAL, M., ۱۹۸۷. Effect of salinity ...
  • Singh, M.P., Singh, D.K., Rai, M., ۲۰۰۷. Assessment of growth, ...
  • Thayumanavan, B., Sadasivam, S., ۱۹۸۴. Physicohemical basis for the preferential ...
  • Thomson, M.J., Ocampo, M.D., Egdane, J., Rahman, M.A., Sajise, A.G., ...
  • Zang, J., Sun, Y., Wang, Y., Yang, J., Li, F., ...
  • Zhang, G.Y., Gua, Y., Lin, C.s., Chen, S.Y., ۱۹۹۵. RFLP ...
  • Jiang, Y., Huang, B. ۲۰۰۱. Drought and heat stress injury ...
  • نمایش کامل مراجع