بررسی فیلوژنی ملکولی عقرب همی اسکورپیوس لپتوروس استان خوزستان براساس توالی DNA ریبوزومی در ناحیه Internal Transcribed Spacers ۲ (ITS۲)۲
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 417
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_VTJ-33-4_012
تاریخ نمایه سازی: 8 خرداد 1400
چکیده مقاله:
عقرب زدگی یکی از مشکلات جدی برای بهداشت عمومی بویژه در استان خوزستان است. عقرب های جنس Hemiscorpius به عنوان یک عامل مهم در زمینه عقرب زدگی و مرگ و میر ناشی از آن بویژه در کودکان مطرح است. یازده نمونه عقرب Hemiscorpius lepturus از ۶ منطقه استان خوزستان صید و پس از شناسایی، استخراج ژنومیک DNA به روش دستی فنل/کلروفرم انجام گرفت. به کمک واکنش زنجیره ای پلیمراز، ژن (Internal transcribed spacer ۲ (ITS۲ با اندازه حدودا ۳۵۰ نوکلئوتید با استفاده از آغازگرهای رفت و برگشت افزوده سازی و سپس توالی یابی گردید. توالی های نوکلئوتیدی به دست آمده با استفاده از برنامه nBLAST موجود در پایگاه اینترنتی NCBI در بانک ژن مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج فیلوژنی نشان داد که درخت فیلوژنی ترسیم شده دارای دو خوشه اصلی A و B است، که با میزان همبستگی ۸۵ درصدی از یکدیگر جدا شدند. خوشه ی A به سه زیر خوشه ی A۱ (شامل: H۸ ,H۹ H۱۱M ,H۵ ,H۴۴ , H۲ و H۱۰) A۲ (شامل: H۲۲ و H۴) و A۳ (شامل: H۱۰M) قابل تقسیم است، که نمونه های موجود در این زیر خوشه ها با هم همبستگی بین ۸۵-۵۴% را نشان دادند. توالی های مورد مطالعه مشابهت نزدیکی (۶/۹۸-۷/۸۱%) با تنها توالی عقرب (Hemiscorpius lepturus(KU۳۴۱۹۸۱ ثبت شده در پایگاه بانک ژن بهمراه تعدادی از عقرب های خانواده Hemiscorpiidae نشان دادند. تنها نمونه عقرب H۹M در خوشه B با فاصله ژنتیکی نسبتا بالایی (۱/۱۹-۷/۱۱%) متمایز از بقیه نمونه ها قرار گرفت، که این یافته احتمالا بیانگر وجود زیر گونه ای متفاوت از عقرب Hemiscorpius lepturus استان خوزستان می باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
کبری چهاری
دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز
عباس جلودار
گروه علوم پایه، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز
هدیه جعفری
انگل شناسی موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، شعبه اهواز، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :