شناسایی ‭miRNA ‬ها و ژن های هدف آن ها در سیگنالینگ خشکی برگ و ریشه برنج از طریق‭Deep RNA sequencing‬

یکی از تنش های محیطی تاثیر گذار در عملکرد برنج تنش خشکی است که تولید آن را در کل جهان تحت تاثیر قرار می دهد. تحمل به خشکی یک صفت کمی است و تغییر در بیان ژن ها نقش مهمی در پاسخ گیاه به تنش خشکی ایفا می کند‭. miRNA‬ها، مولکول های کوچک غیرکدکننده هستند که بیان ژن ها را از طریق ایجاد برش در ‭mRNA ‬یا ممانعت از ترجمه تنظیم می کنند. این مولکول ها در بسیاری از فرآیندهای مختلف بیولوژیکی و متابولیکی گیاه نقش داشته و با تنظیم حساس و دقیق ژن ها، امکان پاسخ مناسب گیاه به تغییرات مراحل رشدی یا شرایط محیطی را فراهم می کنند. در این مطالعه از توالی یابی با کارایی بالا به منظور شناسایی ‭miRNA‬های در گیر در پاسخ گیاه برنج به تنش خشکی استفاده شد. از میان ‮‭708‬ ‭miRNA ‬شناخته شده برنج ‮‭114‬ ‭miRNA ‬در اندام هوایی و ‮‭89‬ ‭miRNA ‬در ریشه تغییر بیان معنی داری را نشان دادند. بسیاری از ‭miRNA‬هایی که تغییر بیان نشان دادند بودند، در تنظیم بیان ژن های کدکننده فاکتورهای رونویسی و پاسخ به تنش نقش دارند. مهم ترین مسیرهایی که این ‭miRNA‬ها در کنترل آنها نقش داشتند، مسیر پیام رسانی اکسین، مسیر پیام رسانی اسید ابسزیک و مسیر کنترل گلدهی گیاه بودند. نقش هورمون های گیاهی در پاسخ به تنش اثبات شده و تنظیم بیان این هورمون ها در سطح پس از رونوشت برداری ژنصهای کدکننده آنها نشان دهنده راهکار گیاه برنج با بکارگیری ‭miRNA‬ها در پاسخ به تنش خشکی می باشد. در این مطالعه همچنین چندین ‭miRNA ‬جدید در برنج شناسایی شد. این نتایج درک بهتری از نقش ‭miRNA‬ها در پاسخ گیاه در مواجه با تنش ارایه داده و نشان داد که ‭miRNA‬ها با ایفای نقش در تنظیم فاکتورهای رونویسینقش مهمی را در کنترل پاسخ برنج به تنش خشکی ایفا می کنند. واژه های کلیدی‭: miRNA‬، برگ و ریشه برنج، سیگنالینگ خشکی