تشخیص اوی باکتریوم (هموفیلوس) پاراگالینارم (عامل کوریزای عفونی) به روش PCR کشت
صاحب اثر: سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
نوع محتوی: طرح پژوهشی
زبان: فارسی
استان موضوع گزارش: البرز
شهر موضوع گزارش: کرج
شناسه ملی سند علمی: R-1057423
تاریخ درج در سایت: 27 بهمن 1397
دسته بندی علمی: علوم کشاورزی
مشاهده: 1,173
تعداد صفحات: 36
سال انتشار: 1391
نسخه کامل طرح پژوهشی منتشر نشده است و در دسترس نیست.
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
چکیده طرح پژوهشی:
تشخیص اوی باکتریوم( هموفیلوس) پاراگالینارم (عامل کوریزای عفونی) به روش PCR و کشت اوی باکتریوم ( هموفیلوس ) پاراگالینارم (Avibacterium Paragallinarum ) باکتری گرم منفی است که عامل ایجاد بیماری حاد تنفسی کوریزای عفونی در طیور می شود. کوریزای عفونی در بیشتر کشور ها دیده می شود و خسارات اقتصادی در کشور های توسعه نیافته به همراه دارد. گله های طیور تخمگذار و مادر در ایران نیز علی رغم مصرف واکسن همچنان بیماری را تجربه ممکن است کنند. آزمایش استاندارد تعیین سرووار های عامل این بیماری انجام HI با استفاده از سرم های استاندارد بروش Kume می باشد. در این روش تاکنون 9 سرووار (4-A-،1 A-،2 A-،3 A-،4 B-،1 C-،1 C-،2 C-،3 C ) شناسایی شده است. این سرووار ها در برخی موارد مشخص گردیده که پوشش ایمنی متقاطع کاملی ما بین خود ندارند. روش اولیه تعیین سروتیپ این باکتری توسط Page معرفی شده بود که بر مبنای روش انجام HI او باکتری هموفیلوس پاراگالینارم به سه ( گروه ) سروتیپ (A، B، C ) طبقه بندی می گردید. باکتری های این گروه بندی پوشش ایمنی در مقابل یکدیگر ایجاد نمی کنند. بر این اساس در کشور ما اطلاعاتی در خصوص سروتیپ های شایع این باکتری وجود ندارد. اخیرا با ابداع روش PCR در تشخیص باکتری و بوجود آمدن امکان تفریق باکتری ها بر اساس گروه بندی Page، این مطالعه به منظور راه اندازی آزمایش واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR) در تشخیص و تعیین سرووار انجام گردید. این مطالعه بر روی دو جدایه مطالعه شده قبلی ایران و دو سرووار استاندارد A، C (وارداتی ) موجود در موسسه رازی که در زرده تخم مرغ ذخیره سازی شده اند انجام گرفت. این جدایه ها بطور غیر عمدی غیر فعال شده و تجدید کشت آنها منفی بوده است. استخراج DNA ژنوم به روش فنل- کلروفرم از زرده تخم مرغ مشخص ساخت در مقایسه با روش های معمول توصیه شده، نیاز مند اعمال تغییراتی در روش کار است. روش استخراج DNA باکتری از زرده تخم مرغ از نظر کیفی تا رسیده به مرحله امکان ردیابی ژنی باکتری در آزمایش PCR بهینه سازی آنها صورت گرفت. این بهینه سازی شامل مقدار آنزیم پروتییناز و مدت زمان آنکوباسیون و نیز انجام دو مرحله شستشو با اتانول بود. سپس محصول های استخراج تحت دو آزمایش مولکولی PCR با استفاده از پرایمر های ویژه گروه باکتری به منظور تعیین حضور ژنوم باکتری و آزمایش PCR دیگر بر اساس پرایمر های منتشر شده مربوط به مکانهای خیلی متغیر توالی ژنی پروتیین هماگلوتینین، جهت تعیین وابستگی آنها به سرووار های A، B، C قرار گرفتند. در نتایج PCR تعیین گروه مشخص شد، همه نمونه ها بجز استاندارد C حاوی ژنوم باکتری می باشند. در آزمایش PCR تعیین سرووار نمونه های DNA استخراج شده، در ژل الکتروفورز محصول مربوط به دو نمونه جدایه استان خراسان (رضوی) باند ویژه سرووار B (bp1100) دیده شد و هیچ یک از نمونه های استاندارد محصولی را نداشتند. درطی این مطالعه همچنین با بدست آوردن جدایه ای تازه از این استان مراحل شناسایی فوق بر روی آن انجام گرفت و پس از شناسایی آن بعنوان سرووار A، محصول PCR مربوطه جهت اطمینان تعیین توالی گردید و مقایسه آن با اطلاعات بانک، جهانی ژنی نشان داد 99درصد همسانی با بخشی از توالی ژنی پروتیین هماگلوتینین سرووار A دارد. همچنین در پروژه، بر روی 17 مورد نمونه سر پرنده های مشکوک ارجاع شده به موسسه، کشت باکتری سواپ سینوسی زیر چشمی بمنظور جدا سازی و آزمایش PCR (ویژه گروه) برای ردیابی حضور باکتری انجام گرفت. این موارد نتایجی بهمراه نداشتند. با توجه به نتایج این مطالعه پیشنهاد بکار گیری این آزمایش در شناسایی و تعیین سرووار باکتری اوی باکتریوم پاراگالینارم، بعنوانی آزمایشی سریع در موارد مشکوک نمونه های بالینی می شود. این گزارش اولین مورد تایید تشخیص سرووار B باکتری اوی باکتریوم پاراگالینارم در ایران می باشد. کلمات کلیدی: اوی باکتریوم پاراگلینارم، زرده تخم مرغ، کوریزای عفونی، تعیین سروتیپ