تنوع ژنتیکی جدایه های ایرانی ویروس زردی شته زاد کدوییان
صاحب اثر: سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
نوع محتوی: طرح پژوهشی
زبان: فارسی
استان موضوع گزارش: تهران
شهر موضوع گزارش: تهران
شناسه ملی سند علمی: R-1056314
تاریخ درج در سایت: 27 بهمن 1397
دسته بندی علمی: علوم کشاورزی
مشاهده: 301
تعداد صفحات: 31
سال انتشار: 1392
نسخه کامل طرح پژوهشی منتشر نشده است و در دسترس نیست.
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
چکیده طرح پژوهشی:
ویروس زردی شته زاد کدوییان (Cucurbit aphid-borne yellows virus، CABYV) یکی از ویروس های ایجاد کننده نشانه های زردی در کدوییان و از اع ضای جنس پولروویروس (Polerovirus) در تیره لوتی ووی ری ده (Luteoviridae) می باشد. در این تحقیق (طی سال های 138-86 )، نمونه های ب رگ ک دو( 1 نمونه) و خربزه ( 66 نمونه) با نشانه های زردی، تردی و شکنندگی برگ ها شبیه به آلودگی به ویروس زردی شته زاد کدوییان (CABYV) از مناطق عمده کشت خ ربزه و ک دو در شش استان کش ور (خ راسان رضوی، سمنان، ته ران، زنجان، آذربایجان ش رقی و اصفهان) جمع آوری و با استفاده از آزمون س رولوژیکی الایزا (DAS-ELISA) مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج بدست آمده نشانگر آلودگی حدود 6 درصد نمونه های جمع آوری شده به ویروس زردی شته زاد کدوییان و انتشار آن در تمام مناطق نمونه برداری بود. آلودگی نمونه های خربزه و کدو به ویروس زردی شته زاد کدوییان به ترتیب برابر با 6 و 53 درصد بود. بیشترین و کمترین میزان آلودگی در نمونه های جمع آوری شده از استان های خراسان (68 ) و زنجان (3 ) مشاهده گردید.آل ودگ ی تعدادی از نم ون ه های ( 120 نمونه) دارای واکن ش مثبت در آزم ون س رولوژیکی الایزا (DAS-ELISA) به ویروس زردی شته زاد کدوییان از طریق انجام واکن ش زنجی ره ای پلی م راز به طری ق ه نسخ ه ب رداری وارون ه (RT-PCR) و با اس ت فاده از یک جفت آغ ازگ ر اخت صاصی ب رای ناحیه ای از ژن پروتیین پ وششی (coat protein، CP) جدایه فرانسوی (CABYV-N) تایید گردید. پس از ازدیاد ق طع ه ای به اندازه تقریبی 8 جفت باز و خالص سازی قطعه ازدیادی، توالی ناحیه ای از ژن پروتیین پوششی شش جدایه ایرانی (CABYV) از شش استان مختلف تعیین گردید. توالی جدایه های ایرانی با یکدیگر و هم چنین با 26 توالی جدایه خارجی قابل دسترس در بانک ژن مقایسه گردید. مقایسه توالی نوکلیوتیدی قسمتی از ژن پروتیین پوششی جدایه های ایرانی ویروس زردی شته زاد کدوییان با جدایه فرانسوی (CABYV-N) نشانگر 96 تا 99 درصد شباهت با یکدیگر بود. درخت تبار زایی ترسیم شده بر اساس توالی نوکلیوتیدی ناحیه CP نشانگر تفکیک تمام جدایه های ویروس زردی شته زاد کدوییان قابل دسترس در بانک ژن به دو گروه (I) و (II) بود. جدایه های متعلق به گروه (I) در دو زیر گروه (Ia) و (Ib) قرار گرفتند. جدایه های خراسان رضوی (1-IR)، اصفهان (2-IR)، زنجان (5-IR) و آذربایجان شرقی (6-IR) به همراه جدایه های آسیایی(چین) ویروس زردی شته زاد کدوییان در زیر گروه (Ib) و جدایه های سمنان (4-IR) وتهران (3-IR) به همراه ج دایه هایی از اروپا (ایتالیا، فرانسه و اسپانیا) و آفریقا (تونس) در زیر گروه (Ia) قرار گرفتند. هیچ کدام از جدایه های ایرانی در گروه (II) قرار نگرفتند. نتایج فوق، احتمال حضور دو جمعیت مستقل (Independent) از ویروس زردی شته زاد کدوییان در مناطق نم ون ه ب رداری را م طرح می نماید. واژه های کلیدی ویروس زردی شته زاد کدوییان، واکنش زنجیره ای پلیمراز و تعیین توالی
نویسندگان