پایگاه داده پروتیوم گیاهی در پاسخ به تنش

تخمین زده شده که حدود 75 درصد محصولات گیاهی در اثر استرس های محیطی از بین می روند ٬ این مشکل حتی در کشاورزی مدرن و مکانیزه نیز دیده می شود. یکی از راههای موثر در بهبود حاصلخیزی محصولات کشاورزی و مبارزه با عوامل استرس زا استفاده ازعلم بیوتکنولوژی است. شناسایی ژن ها و پروتیین هایی که باعث سازگاری گیاهان با طیف وسیعی از عوامل استرس زای محیطی می شوند یکی از مراحل کلیدی در علم بیوتکنولوژی است. از طرفی به دلیل افزایش روز افزون مقالات چاپ شده در حوزه پروتیومیکس استرس های گیاهی٬ چالش بزرگی در دسترسی و داده کاوی این اطلاعات در راه محققان این علم قرار گرفته است. پایگاه داده های پروتیوم استرس های گیاهی (PlantPReS;www.proteome.ir) که یک پایگاه آنلاین است از اکتبر سال 2015 شامل بیش از 20413 ورودی ثبت شده از 456 مقاله است که به صورت دستی وارد شده٬ همچنین حاوی بیش از 10600 پروتیین منحصر به فرد در پاسخگویی به استرس است. نام هر پروتین٬ شماره دسترسی آن ٬ نوع گیاه و بافت و یا اندامک مورد مطالعه ٬ نوع استرس و مرحله ای از رشد گیاه که استرس به آن وارد شده در این پایگاه داده به راحتی قابل دسترسی است. علاوه بر این٬ PlantPReS قابلیت تجزیه و تحلیل های چند منظوره در پایگاه داده با استفاده از حالت فیلتراسیون را برای محققان فراهم می کند. نتایج هر ورودی به سری از پروتیین ها اشاره دارد که حاوی مجموعه ای از معیار های انتخابی است. نتایج هر ورودی می تواند به صورت متن یا فرمت های گرافیکی نمایش داده شوند.کلمات کلیدی: پایگاه داده ها٬ استرس گیاهی٬ پروتیومیکس