کارگاه آموزشی: کارگاه EPITOPE MAPPING

کارگاه EPITOPE MAPPING روز سه شنبه، 20 آذر، 1397 توسط پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری در شهر تهران استان تهران برگزار می شود.

برنامه کارگاه

•   مباحث تئوری

1. کلیات  Epitope Mapping  (مقدمه، اهمیت و کاربردها) 
2. ویژگی های نواحی آنتی ژنیک پروتئینی ( با رویکرد طراحی واکسن)
3. رویکردهای نوین در Epitope Mapping
4. شناسایی نواحی آنتی ژنیک شاخص سلول های T
5. معرفی پرکاربردترین الگوریتم های محاسباتی
6. بر اساس توالی
7. براساس ساختار 
8. روش های ارزیابی و پیش بینی اپی توپ های متصل شونده به MHC-I  
9. روش های ارزیابی و پیش بینی اپی توپ های متصل شونده به MHC-II
10. شناسایی نواحی آنتی ژنیک شاخص سلول های B
11. معرفی پرکاربردترین الگوریتم های محاسباتی
12. بر اساس توالی
13. براساس ساختار
14. روش های ارزیابی و پیش بینی اپی توپ های خطی شاخص سلول های B
15. روش های ارزیابی و پیش بینی اپی توپ های فضایی شاخص سلول های B
16. طراحی پروتئین فیوژن برای دمین های واجد اپی توپ
17. تیتر و بررسی آنتی بادی ترشح یافته بر علیه اپی توپ ها در مدل های حیوانی

• مباحث عملی
• شناسایی نواحی آنتی ژنیک شاخص سلول های T با استفاده از پرکاربردترین نرم افزارها و پایگاه های داده :

   IEDB Analysis Resource، SYFPEITHI Database، CTLPred Software،...)

• شناسایی نواحی آنتی ژنیک شاخص سلول های B با استفاده از پرکاربردترین نرم افزارها و پایگاه های داده :
• IEDB Analysis Resource، DiscoTop، ElliPro،   IgPred software، ...)

مدرسین کارگاه:

دکتر نجف الهیاری فرد(عضو هیات علمی پژوهشگاه ملی و مهندسی ژنتیک )

احسان رئوفی(دانشجوی دکترای بیوتکنولوژی پزشکی دانشگاه علوم پزشکی ایران)

دکتر شیما توکل(عضو هیات علمی دانشگاه علوم و پزشکی ایران)