مقایسه تکرار های شناسایی شده در شترهای دو کوهانه با دیگر گونه ها

عناصر متحرک (TE ها) توالی های تکراری DNA هستند که در ژنوم پیدا می شوند در سراسر درخت زندگی پراکنده اند و اغلب به خاطر توانایی آنها در تکرار و حرکت به مکان های جدید ژنومی به عنوان ژن های پرشی نامیده می شوند. همچنین آنها منبع مهمی از تنوع ژنومی در هر دو سطح گونه و فردی فراهم می کند. این مطالعه با هدف شناسایی عناصر متحرک در ژنوم شترهای دوکوهانه جهت استفاده در تنوع زیستی بالقوه انجام گرفت. جهت انجام آن توالی کامل ژنوم شتر دوکوهانه با استفاده از روش توالی یابی نسل جدید تهیه و سرهم سازی شد سپس از طریق برنامه Repeat Masker v4.0.7 با ترکیب دو پایگاه اطلاعاتی Repbase و Dfam برای جستجوی عناصر متحرک شناسایی شده در ژنوم ها مورد استفاده قرار گرفت. بر اساس نتایج به دست آمده محتوای توالی های تکراری به دست آماده شتر های دوکوهانه 30/02 درصد که اندکی کمتر از شتر تک کوهانه آفریقایی با 33/72% و شتر دو کوهانه با 33/68% بود که خانواده LINE با 17.79 درصد توالی های تکراری بزرگترین گروه توالی های تکراری در شترهای دوکوهانه هستند. همچنین این مقدار کمتر از شتر تک کوهانه آفریقایی (19/8%) و شتر دوکوهانه (19/32%) بود. در این خانواده LINE1 با 13/20% و RTE با 0/17 % به ترتیب بیشترین و کمترین سهم را به خود اختصاص داده اند.

کلیدواژه ها:

شتر های دوکوهانه ، عناصر متحرک ، سرهم سازی ، تنوع زیستی.