آزمون نتاج جدایه ایرانی ویروئید اگزوکورتیس مرکبات در دو پایه حساس و متحمل

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 397

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPPS-50-1_001

تاریخ نمایه سازی: 2 آذر 1398

چکیده مقاله:

ویروئید اگزوکورتیس مرکبات Citrus exocortis viroid (CEVd)، عامل یکی از بیماری های مهم اقتصادی به نام اگزوکورتیس مرکبات است . در این پژوهش، چندشکلی توالی نوکلئوتیدی و ساختار جمعیت CEVd در دو میزبان متحمل و حساس (به ترتیب، نارنج (Citrus aurantium L.) و سیترنج ((Poncirus trifoliata (L.) Raf. × C. sinensis (L.)) بررسی شد. رونوشت تمام طول برآمده از جدایه ایرانی CEVd-S1 در شرایط درون شیشه ای جهت آلوده سازی مکانیکی نهال ها استفاده شد. تنوع ژنتیکی جمعیت های CEVd با به کارگیری چندشکلی فضایی تک رشته ای (SSCP) و توالی یابی نوکلئوتیدی تعیین شد. بررسی ژنوم ویروئید همسانه سازی شده در این دو میزبان، تاثیر گونه میزبان بر تغییرهای ژنتیکی جمعیت برآمده از یک جدایه CEVd را آشکار کرد. نتیجه های این پژوهش نشان دادند که ساختار جمعیتی ویروئید اگزوکورتیس مرکبات در دو میزبان حساس و متحمل متفاوت و در میزبان متحمل متنوع تر از میزبان حساس است. بررسی ساختار ثانویه ترمودینامیکی واریانت ها نشان داد که تغییرهای شناسایی شده در ژنوم ویروئید در این پژوهش تاثیر چشمگیری در ساختار کلی میله ای شکل ویروئید نداشته است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مرضیه قباخلو

دانشجوی دکتری، گروه گیاه پزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران

اکبر دیزجی

دانشیار، گروه گیاه پزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران

احد یامچی

استادیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولیدات گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، ایران

حشمت رحیمیان

استاد، گروه گیاه پزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bani-Hashemian, S. M., Taheri, H., Alian, Y .M., Bove, J. ...
  • Barbosa, C. J., Pina, J. A., Navarro, L. & Duran-Vil, ...
  • Bernad, L. & Duran-Vila, N. (2006). A novel RT-PCR approach ...
  • Bernad, L., Duran-Vila, N. & Elena, S. F. (2009). Effect ...
  • Chaffai, M., Serra, P., Gandia, M., Hernandez, C. & Duran-Vila, ...
  • Creste, S., Neto, A. T. & Figueira, A. (2001). Detection ...
  • Di-Serio, F., Li, S. F., Pallas, V., Owens, R. A., ...
  • Elleuch, A., Hamdi, I., Bessaies, N. & Fakhfakh, H. (2013). ...
  • Eiras, M, Targon, M. L. P., Fajardo, T. V., Flores, ...
  • Fawcett, H. S. & Klotz, J. (1948). Exocortis of trifoliate ...
  • Flores, R., Daros, J. A. & Navarro, J. A. (2003). ...
  • Gandia, M., Bernad, L., Rubio, L. & Duran-Vila, N. (2007). ...
  • Gandia, M., Palacio, A. & Duran-Vila, N. (2000). Variability of ...
  • Garcia-Arenal, F., Fraile, A. & Malpica, J.M. (2003). Variation and ...
  • Garnsey, S. M. & Jones, J. W. (1967). Mechanical transmission ...
  • Ghobakhloo, M., Dizadji, A. & Yamchi, A. (2016). Infectivity of ...
  • Gomez, G. & Pallas, V. (2007). Mature monomeric forms of ...
  • Gozmanova, M., Denti, M. A., Minkov, I. N., Tsagris, M. ...
  • Habashi, M. (1988). Survey of citrus exocortis disease in northern ...
  • Hadidi, A., Flores, R., Randles, J. & Semancik, J. (2003). Viroids. ...
  • Hadidi, A., Vidalakis, G. & Sano, T. (2017). Economic significance ...
  • Hajeri, S. (2010). Study of Molecular and Biological Properties of ...
  • Hajeri, S., Ramadugu, C., Manjunath, K., Ng, J., Lee, R. ...
  • Hall, T. A. (1999). BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment ...
  • Librado, P. & Rozas, J. (2009). DnaSP v5: A software ...
  • Lin, C. Y., Wu, M. L., Shen, T. L., Yeh, ...
  • Matousek, J., Orctova, L., Ptaek, J., Patzak, J., Dedic, P., ...
  • Matzura, O. & Wennborg, A. (1996). RNAdraw: An integrated program ...
  • Murica, N., Bernad, L., Duran-Vila, N. & Serra, P. (2011). ...
  • Nie, X. (2012). Analysis of sequence polymorphism and population structure ...
  • Qi, Y. & Ding, B. (2003). Inhibition of cell growth ...
  • Roossinck, M. J. (2008). Plant virus evolution. Springer-Verlag. ...
  • Sambrook, J. & Russell, D. (2001). Molecular Cloning: A Laboratory ...
  • Semancik, J. S., Szychowski, J. A., Rakowski, A. G. & ...
  • Szychowski, J. A., Vidalakis, G. & Semancik, J. S. (2005). ...
  • Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. & Kumar, ...
  • Visvader, J. E. & Symons, R. H. (1985). Eleven new ...
  • Zhu, Y., Qi, Y., Xun, Y., Owens, R. & Ding, ...
  • نمایش کامل مراجع