Quantitative structure-activity relationship (QSAR) study of CCR2b receptor inhibitors using SW-MLR and GA-MLR approaches
محل انتشار: فصلنامه ارتباطات شیمی ایران، دوره: 5، شماره: 1
سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 345
فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ICC-5-1_010
تاریخ نمایه سازی: 2 مهر 1398
چکیده مقاله:
In this paper, the quantitative structure activity-relationship (QSAR) of the CCR2b receptor inhibitors was scrutinized. Firstly, the molecular descriptors were calculated using the Dragon package. Then, the stepwise multiple linear regressions (SW-MLR) and the genetic algorithm multiple linear regressions (GA-MLR) variable selection methods were subsequently employed to select and implement the prominent descriptors having the most significant contributions to the activities of the molecules. A combined data set including numerical values of inhibition activity data (IC50) of 103 CCR2b receptor derivatives was adopted for our simulations. This study revealed that both SW-MLR and GA-MLR methods consisted of six molecular descriptors. The adopted descriptors belong to topological, charge, RDF and atom-centered fragments classes. A comparison of results by the two methodologies indicated the superiority of GA-MLR over the SW-MLR method. The authenticity of the proposed model (GA-MLR) was further confirmed using the cross-validation, validation through an external test set and Y-randomization.
کلیدواژه ها:
QSAR ، CCR2b receptor inhibitors ، Genetic algorithm (GA) ، Stepwise (SW) ، Multiple linear regression (MLR) ، Molecular descriptor
نویسندگان
Mehdi Nekoei
Department of Chemistry, Shahrood Branch, Islamic Azad University, shahrood, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :