Quantitative structure-activity relationship (QSAR) study of CCR2b receptor inhibitors using SW-MLR and GA-MLR approaches

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 345

فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ICC-5-1_010

تاریخ نمایه سازی: 2 مهر 1398

چکیده مقاله:

In this paper, the quantitative structure activity-relationship (QSAR) of the CCR2b receptor inhibitors was scrutinized. Firstly, the molecular descriptors were calculated using the Dragon package. Then, the stepwise multiple linear regressions (SW-MLR) and the genetic algorithm multiple linear regressions (GA-MLR) variable selection methods were subsequently employed to select and implement the prominent descriptors having the most significant contributions to the activities of the molecules. A combined data set including numerical values of inhibition activity data (IC50) of 103 CCR2b receptor derivatives was adopted for our simulations. This study revealed that both SW-MLR and GA-MLR methods consisted of six molecular descriptors. The adopted descriptors belong to topological, charge, RDF and atom-centered fragments classes. A comparison of results by the two methodologies indicated the superiority of GA-MLR over the SW-MLR method. The authenticity of the proposed model (GA-MLR) was further confirmed using the cross-validation, validation through an external test set and Y-randomization.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

Mehdi Nekoei

Department of Chemistry, Shahrood Branch, Islamic Azad University, shahrood, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • J. Saunders, C.M. Tarby, Drug Discov. Today, 1999, 4, 80-92. ...
  • M. Navab, S.Y. Hama, T.B. Nguyen, A.M. Fogelman, Coron. Artery ...
  • J.H. Gong, L.G. Ratkay, J.D. Waterfield, I. Clarc-Lewis, J. Exp. ...
  • C.M. Lloyd, A.W. Minto, M.E. Dorf, A. Proudfoot, T.N.C. Wells, ...
  • K.J. Kennedy, R.M. Strieter, S.L. Kunkel, N.W. Lukacs, W.J. Karpus, ...
  • V. Consonni, R. Todeschini, M. Pavan, J. Chem. Inf. Comput. ...
  • K. Benyounis, A. Olabi, Adv. Eng. Softw., 2008, 39, 483-496. ...
  • M. Mohammadhosseini, Asian J. Chem., 2012, 24, 3814-3820. ...
  • M. Mohammadhosseini, O. Deeb, A. Alavi-Gharabagh, M. Nekoei, Anal. Chem. ...
  • M. Mohammadhosseini, M. Nekoei, Asian J. Chem., 2013, 25, 349-352. ...
  • M. Mohammadhosseini, H.A. Zamani, H. Akhlaghi, M. Nekoei, J. Essent. ...
  • E.P. Box, N.R. Draper, Empirical Model Building and Response Surfaces, ...
  • M. Nekoei, M. Mohammadhosseini, A. Alavi-Gharahbagh, Anal. Bioanal. Electrochem., 2009, ...
  • M. Mohammadhosseini, Anal. Chem. Lett., 2013, 3, 226-248. ...
  • M. Mohammadhosseini, J. Chem. Health Risks, 2014, 4, 75-95. ...
  • M. Imai, T. Shiota, K.-i. Kataoka, C.M. Tarby, W.J. Moree, ...
  • W.J. Moree, K.-i. Kataoka, M.M. Ramirez-Weinhouse, T. Shiota, M. Imai, ...
  • W.J. Moree, K.-i. Kataoka, M.M. Ramirez-Weinhouse, T. Shiota, M. Imai, ...
  • D. Goldberg, Genetic Algorithms & Engineering Optimization, Wiley, New York, ...
  • M. Nekoei, M. Salimi, M. Dolatabadi, M. Mohammadhosseini, Monatsh. Chem., ...
  • M. Nekoei, N. Goudarzi, S. Nekoei, M. Mohammadhosseini, Anal. Chem. ...
  • M. Nekoei, M. Mohammadhosseini, E. Pourbasheer, Med. Chem. Res., 2015, ...
  • M. Nekoei, M. Salimi, M. Dolatabadi, M. Mohammadhosseini, J. Serb. Chem. ...
  • G. Mitsuo, C. Runwei, Genetic Algorithms & Engineering Optimization, John ...
  • S. Ahmad, M.M. Gromiha, J. Comput. Chem., 2003, 24, 1313-1320. ...
  • J. Hunger, G. Huttner, J. Comput. Chem., 1999, 20, 455-471. ...
  • C.L. Waller, M.P. Bradley, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1999, ...
  • M. Shahlaei, A. Fassihi, L. Saghaie, E. Arkan, A. Pourhossein, ...
  • R. Wehrens, H. Putter, L.M. Buydens, Chemometr. Intell. Lab. Syst., ...
  • P. Gramatica, QSAR Comb Sci., 2007, 26, 694. ...
  • S. Riahi, M.R. Ganjali, E. Pourbasheer, P. Norouzi, Chromatographia, 2008, ...
  • S. Riahi, E. Pourbasheer, M.R. Ganjali, P. Norouzi, Chem. Biol. ...
  • R. Todeschini, V. Consonni, Handbook of Molecular Descriptors, John Wiley ...
  • D. Bonchev, Information-Theoretic Indices for Characterization of Chemical Structures, RSP/Willey,, ...
  • D.L. Massart, B.G.M. Vandeginste, L.M.C. Buydens, S.D.E. Jong, Leui, P. ...
  • نمایش کامل مراجع