بررسی تاثیر مهارکنندگی متابولیت گیاهی پاپاورین و مشتقات طراحی شده آن، بر پروتئاز HIV با استفاده از روش داکینگ مولکولی

پروتئاز HIV از خانواده ی آسپارتیک پروتئازها می باشد و از لحاظ ساختاری به صورت یک همودایمر فعالیت می کند. به دلیل نقش مهم و ضروری آنزیم پروتئاز در تکمیل چرخه ی عفونی ویروس HIV، داروهای فراوانی به موجب مهار این پروتئاز طراحی شده اند. گیاهان منبع مهمی برای کشف و توسعه ی محصولات جدید با ارزش دارویی هستند. پاپاورین یکی از آلکالوئیدهای گروه بنزیل ایزوکوینولینی است. مطالعات انجام گرفته حاکی از آن است که این ترکیب دارای قدرت مهارکنندگی آنزیم پروتئاز HIV می باشد. در این مطالعه با روش های شبیه سازی دینامیک مولکولی و داکینگ مولکولی به بررسی جایگاه های اختصاصی اتصال، جهت مهار پروتئاز ویروس HIV از میان متابولیت های ثانویه گیاهی می پردازیم. به این منظور اثر مهاری پاپاورین و 11 ترکیب از مشتقات آن را بر پروتئاز HIV بررسی کردیم ، که در میان این ترکیبات ترکیب D10 از مشتقات پاپاورین دارای بهترین اتصال و ثابت مهار 203.39nm بود . هدف اصلی از این تحقیق معرفی نواحی مهم و اسیدآمینه های کلیدی در روند مهار پروتئاز HIV می باشد.

کلیدواژه ها:

پروتئاز HIV ، متابولیت ثانویه گیاهی ، پاپاورین ، شبیه سازی دینامیک مولکولی ، داکینگ مولکولی طراحی دارو