تعیین توالی اگزون شماره 2 ژن 9GDFگوسفندان عربی و بهمئی و اثرات جهش تک نوکلئوتیدی بر ساختار و عملکرد پروتئین

چندقلوزایی یکی از صفات مهم اقتصادی در گوسفند میباشد که تحت تاثیر محیط و ژنتیک بوده و افزایش آن با سودمندی اقتصادی همراه است. بنابراین افزایش درصد دوقلوزایی از دیدگاههای موجود در بهبود صفات اقتصادی است. یکی از ژنهای کاندیدا برای چندقلوزایی پروتئین GDF9 فاکتور رشد و تمایز 9 است. پروتئین GDF9 یک فاکتور رشد برای سلول های گرانولوزا و میتواند به عنوان کنترلکننده رشد سلولهای کومولوس و تمایزدهنده سلولهای گرانولوزا باشد. ژن GDF9 دارای دو اگزون و یک اینترون به طول 1126 جفت باز بوده که جهش های رخ داده در این ژن بر روی تولیدمثل تاثیرگذار می باشد. هدف از این تحقیق تعیین توالی اگزون شماره 2 ژنGDF9 گوسفندان عربی و بهمئی و اثرات جهش تک نوکلئوتیدی بر ساختار و عملکرد پروتئین با استفاده از روشهای بیوانفورماتیکی بود. نمونه های خون از تعداد 50 راس گوسفند عربی ایستگاه تحقیقاتی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان و 35 راس گوسفند بهمئی از ایستگاه تحقیقاتی بهمئی جمع آوری شد. پس از استخراج DNA، یک قطعه 1069 جفت بازی از اگزون شماره 2 ژن GDF9 تکثیر شد. سپس نمونه ها با کمک شرکت BIONEER کره جنوبی توالی یابی شدند. توالی ای بدست آمده توسط نرم افزار bio Edit پردازش و با کمک وب سایت NCBI همردیف گردیدند. پس از آنالیز داده ها مشخص شد که تغییری در توالی نوکلئوتیدی GDF9 گوسفند عربی رخ نداده است اما در گوسفند بهمئی یک جهش تک نوکلئوتیدی مشاهده شد. این جهش سبب شده که نوکلئوتید آدنین (A) جایگزین سیتوزین (C) شود. پس از ترجمه توالی DNAی حاوی جهش به توالیهای پروتئینی، و مقایسه آن با توالی مرجع ثبت شده در NCBI مشخص شد این جهش تغییری در ساختمان سوم پروتئین ایجاد نمی کند و از نوع جهش خاموش می باشد.