آنالیز مولکولی جدایه های قارچ Fusarium culmorum عامل بیماری پوسیدگی طوقه و ریشه گندم با استفاده از نشانگر SSR

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 477

فایل این مقاله در 19 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPPS-49-2_014

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

بیماری پوسیدگی طوقه و ریشه گندم برآمده از Fusarium culmorum یکی از مهم ترین بیماری های گندم در استان ایلام است. برای تعیین گوناگونی ژنتیکی بیمارگر در مزرعه های گندم استان ایلام، شمار 66 نمونه آلوده از مزرعه های شهرستان های گوناگون استان جمع آوری شد. پس از کشت، خالص سازی و شناسایی جدایه ها، آزمون مولکولی با به کارگیری پنج جفت آغازگر ریز ماهواره انجام شد. از آغازگرهای ریز ماهواره 25 آلل در جدایه ها تکثیر شد. میانگین تعداد آلل در هر جایگاه 2/5 مشاهده شد. شناسه چندشکلی نشانگرها در آغازگر F3 با 409/0 بیشترین و در آغازگر F11 با 179/0 کمترین مقدار را دارا بود. بر پایه خوشه بندی جدایه ها و با به کارگیری الگوریتم پیوست مجاور و نرخ همانندی جاکارد، در سطح همانندی 50 درصد جدایه ها در 18 گروه جدا از هم قرار گرفتند. نتیجه های تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که 78 درصد از تنوع ژنتیکی در میان همه جدایه ها و تنها 22 درصد آن به منطقه های گوناگون جغرافیایی اختصاص دارد؛ بنابراین میان جدایه ها از منطقه های گوناگون همانندی ژنتیکی فراوانی وجود دارد. همانندی ژنتیکی بالا را می توان به مهاجرت ژن یا ژن مانه (ژنوتیپ) در اثر عامل های گوناگون نسبت داد.

نویسندگان

خشنود نوراللهی

دانشیار بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ایلام، ایران

فرهاد غلامی

دانشجوی سابق کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ایلام، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abdei-Satar, M. A., Khalil, M. S., Mohmed, I. N., Abdel-Salam, ...
  • Akinsmani, O. A., Backhouse, D., Simpfendorfer, F. & Chakraborty, S. ...
  • Bogale, M. (2006). Molecular characterization of Fusarium isolates from Ethiopia, Ph.D. ...
  • Carbone, I. & Kohn, L. M. (2001). A microbial population ...
  • Corzza, L., Balmas, V., Santori, A., Vitale, S., Luongo, M. ...
  • Datta, S., Choudhary, R. G., Shamim, M. D., Singh, R. ...
  • Desjardins, A. E. (2006). Fusarium mycotoxines: chemistry, Genetics and biology. APS ...
  • De Nijs, M., Larsen, J. S., Gams, W., Rombouts, F. ...
  • Draper, M. A. (2000). Common root and crown rots of wheat ...
  • FakhFakh, M. M., Yahyaoui, A., Rezgui, S., Elias, E. M. ...
  • Giraud, T., Fournier, E., Vautrin, D., Solignac, M., Vercken, E., ...
  • Gurel, F. G., Albayrak, O., Diken, E. & Tunlai, B. ...
  • Hambelton, S., Walker, C. & Kohn, L. M. (2002). Clonal ...
  • Khodabandeh, N. (2005). The cultivations of crops. Sepehre Press. (in Farsi) ...
  • Leslie, J. F. & Summerell, B. A. (2006). The Fusarium laboratory manual ...
  • McDonald, B. A. (1997). The population genetics of fungi: tools ...
  • Miedaner, T., Schllind, A. G. & Geiger, H. H. (2001). ...
  • Miedaner, T., Cumagun, C. J. R. & Chakraborty, S. (2008). ...
  • Miedaner, T., Caixeta, F. & Talas, F. (2013). Head-blighting populations ...
  • Mishra, P. K., Fox, R. T. V. & Cutham, A. ...
  • Mohammadi, S. A. & Prassana, B. M. (2003). Analysis of ...
  • Nei, M. (1972). Genetic distance between populations. American Naturalist, 106, 283-292. ...
  • Nei, M. & Li, W. H. (1979). Mathematical model for ...
  • Nicolson, P., Jenkinson, P., Rezanoor, H. N. & Parry, D.W. ...
  • Nourollahi, Kh., Haghi Z. & Mehrabi oladi, A. A. (2014). ...
  • Nourollahi, Kh. & Shahbazi, M. (2015). Study on genetic structure ...
  • Polley, R. W. & Turner, J. A. (1995). Surveys of ...
  • Pouzeshimiab, B., Razavi, M., Zamanizadeh, H. R., Zare, R. & ...
  • Pouzeshimiab, B., Razavi, M., Zare, R., Zamanizadeh, H. R., Rezaee, ...
  • Puhalla, J. E. (1981). Genetic considerations of the genus Fusarium. In ...
  • Ravanlou, A. & Banihashemi, Z. (1999). Taxonomy and pathogenicity of Fusarium spp. ...
  • Ribichich, K. F., Lopez, S. E. & Vegetti, A. C. ...
  • Rolhf, F. J. (1990). NTSYSPc, Numerical taxonomy and multivariant analysis system. ...
  • Safaee, D, Younesi, H. & Sheikholeslami, M. (2012). Fusarium species that root ...
  • Saremi, H. (2006). Fusarium, biology, ecology and taxonomy. Jehad Daneshgahi Press, ...
  • Saremi, H., Ammarlou, A. & Jafary, H. (2007). Incidence of ...
  • Scherm, B., Balmas, V., Sponu, F., Pani, G., Delogu, G., ...
  • Scott, J. B. & Chakraborty, S. (2010). Genotypic diversity in Fusarium ...
  • Smiley, R. & Whittaker, R. (2004). Lesion nematodes reduce yield in ...
  • Toth, B., Mesterhazy, A., Nicolson, P., Teren, J. & Varga, ...
  • نمایش کامل مراجع