پیش بینی ساختار سوم پروتیین بر اساس مدل پنهان مارکوف

پیش بینی ساختار سوم پروتیین باعث می شود که عملکرد پروتیین در بدن انسان شناسایی گردد و درتشخیص بیماری ها و طراحی دارو نقش مهمی ایفا می کند. در مقایسه با تعداد بسیار زیاد توالی پروتیین شناخته شده، ساختار تعداد کمی از پروتیین ها مشخص شده است. با رشد بیشتر شکاف بین توالی ها و ساختمان های شناخته شده، نیاز به توسعه روشدهای پیشگویی که قابل اعتماد باشند افزایش یافتهاست. الگوریتم پیشنهادی با استفاده از داده های دنباله پروتیینها و مختصات جغرافیایی اتم کربن اصلی در ستون فقرات آمینو اسیدها مدلی بر مبنای شبکه براوه مکعبی با استفاده از مدل پنهان مارکوف ایجاد شده است. مدل پنهان مارکوف توانسته است دقت بیشتری به صورت کلی نسبت به سایر روش ها کسب کند. مختصات سه بعدی اتم های کربن اصلی کمک شایانی به بهبود دقت روش پیشنهادی کرده است و توانسته مسیر حرکت توالی های آمینو اسید های پروتیین های داده هایآموزشی در مختصات سه بعدی را به خوبی یادگیری کند و داده ای آزمایشی را به هر فولد مرتبط انتساب دهد.

کلیدواژه ها:

تعیین ساختار پروتیین ، ساختار سوم پروتیین ، بیوانفورماتیک ساختاری ، مدل پنهان مارکوف ، شبکه براوه ، فولد