جداسازی گونه Staphylococcus saprophyticus از درختان انار با عارضه دانه سفیدی در خراسان جنوبی

انار یکی از محصولات باغی مهم در استان خراسان جنوبی می باشد که در سال های گذشته کیفیت میوه با عارضه دانهسفیدی کاهش یافته و صادرات آن با مشکل مواجه شده است باکتری های اندوفیتی به آن دسته از باکتری هایی کهبافت داخلی گیاه را کلونیزه میکنند بدون اینکه علایم ظاهری عفونت یا اثر منفی روی میزبانشان را نشان دهند، گفتهمی شود . در این پژوهش جداسازی اندوفیت های باکتریایی درختان انار با عارضه دانه سفیدی انجام شد. نمونه برداری ازبرگ، از پنج منطقه انارکاری باغ دانشگاه آزاد فردوس و اسلامیه دارای سابقه عارضه سفیدی، باغستان سفلی، با عارضهکم و باغستان علیا و فتح آباد بدون عارضه انجام شد. ویژگی های پرگنه های استرین های جداسازی شده برای هر جدایهثبت گردید و براساس آزمون های فنوتیپی گروهبندی شدند. داده های حاصل از این آزمایشات صورت مثبت بودن با کدیک و منفی بودن کد صفر مشخص شد و مرتب سازی داده ها در نرم افزار Excel انجام گرفت. داده های حاصل به نرمافزار NTSYS PC وارد شدند. دندروگرام بین جدایه ها به روش UPGMA با ترسیم خوشه ای انجام گرفت.پس از آنجدایه ها با استفاده از PCR شناسایی شدند. DNA ژنومی استخراج و ناحیه 16Srna تکثیر و تعیین توالی شد.سپسالکتروفورز نتیجه PCR در ژل و عکسبرداری از ژل انجام شد. توالی های محصولات PCR با استفاده از نرم افزار DNA Star همردیف و مرتب شده و در پایگاه NCBI دادهها بلاست و شباهت نمونه ها با گونه های شناخته شده تعیین گردید.فیلوژنی نمونه ها با استفاده از نرم افزار کلاستال دبلیو همردیف و سپس در نرم افزار مگا ورژن 6 با استفاده از الگوریتمنزدیکترین همسایگی کلاستر مربوطه ترسیم و مورد مقایسه قرار گرفت.بر اساس نتایج گونه غالب جداسازی شده از برگانار دارای علایم دانه سفیدی Staphylococcus saprophyticus بود که تا کنون از بافت های گیاهی جداسازینشده و نیازمند تحقیقات بیشتر میباشد.

کلیدواژه ها:

انار ، دانه سفیدی ، باکتری ، اندوفیت