ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

High Throughput Virtual Screening of Chinese Medicinal Plant Database for Antagonist Discovery Against Human Toll-Like Receptor 4

تعداد صفحات: 1 | تعداد نمایش خلاصه: 198 | نظرات: 0
سال انتشار: 1395
کد COI مقاله: BIOC01_190
زبان مقاله: انگلیسی
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

مشخصات نویسندگان مقاله High Throughput Virtual Screening of Chinese Medicinal Plant Database for Antagonist Discovery Against Human Toll-Like Receptor 4

Mobina Azimi - Dept. of Agronomy, Faculty of Agriculture, University of Zanjan
Bahram Maleki - Dept. of Agronomy, Faculty of Agriculture, University of Zanjan
Abbas Bahari - RIMBT, University of Zanjan
Milad Lagzian - Dept. of Biology, Faculty of science, University of Sistan and Baluchestan

چکیده مقاله:

Toll-like receptors are conserved parts of immune system in animals and humans. They have a trans- membrane domain and also an extracellular region composed of 18-25 copies of a Lucien-rich repeat (LRR). After encounter with a viral and bacterial ligand, a signaling pathway is started to sense pathogens and initiate of innate immune system responses against microbial components. TLR4 are expressed by many types of cells, including mac-rophages, dendritic cells, B cells, and certain epithelial cells. Because TLR4 has a pivotal role in inflammation response, identification of active pharmaceutical compounds which could active this receptor is very important.In this study over 57,000 active compounds originated from medicinal plants were used in high throughput vir-tual screening techniques against TLR4. Ligands preparation was done by BIOVIA Discovery Studio 2016 to optimized valance, charges and also create all tautomer form of each ligand which finally make the library with more than 229656 records. After that receptor preparation (4G8A) was performed to remove water molecules and to optimize the structures using LigPrep module in Schrodinger2015-2. Active Site Mapping was used based on previous reports to identify key catalytic residue. Docking was conducted with three levels precision including HTVS (with output 2463), SP (with output 1692) and finally XP (with output 216) by the Glide module of Schro-dinger 2015-2. The outputs of last docking step (XP) were subjected to re-ranking docking algorithm of MOE,CLC Drug Discovery, ICM-Pro and Schrodinger 2015-2. The best lead for TLR4 activation were picked out ac-cording to the average docking scores of the above mentioned software. The top binder was synthesized and used for in-vitro cell culture experiments which in preliminary result give some promising result.

کلیدواژه ها:

virtual screening, Medicinal Plants ، TLR4

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/731859/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Azimi, Mobina و Maleki, Bahram و Bahari, Abbas و Lagzian, Milad,1395,High Throughput Virtual Screening of Chinese Medicinal Plant Database for Antagonist Discovery Against Human Toll-Like Receptor 4,اولین کنفرانس ملی یافته های نوین زیست شناسی,زاهدان,,,https://civilica.com/doc/731859

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1395, Azimi, Mobina؛ Bahram Maleki و Abbas Bahari و Milad Lagzian)
برای بار دوم به بعد: (1395, Azimi؛ Maleki و Bahari و Lagzian)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه دولتی
تعداد مقالات: 7,863
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی