مطالعه توالی های هسته ایی nrDNA ITS و طبقه بندی سیستماتیک گونه هایی از جنس Allium در ایران

جنس آلیوم احتمالا بزرگترین جنس از تک لپه ایهاست که در حدود 850 گونه را شامل می شود. این جنس به صورت طبیعی در جنوب شرق و مرکز آسیا پراکنده شده است. گونه های جنس آلیوم که اخیرا برای ایران شناسایی شده اند به 7 زیر جنس و 29 بخش تعلق دارند. در این مطالعه توالی های نوکلیوتیدی ITS از داده های موجود در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی NCBI برای 21 گونه از آلیوم به دست آمد و از آنها برای استنتاج کردن ارتباطات درون گونه ایی توسط روش های آنالیزی بیشینه صرفه جویی و Bayesian استفاده به عمل آمد. همترازی توالی های ITS برای 21 گونه آلیوم انجام شد. میانگین درصد واگرایی توالی ها در میان گونه های مورد مطالعه، 17,4 % و بیشینه واگرایی بین A A. noeanum و oleraceum 34.41% بود. علاوه بر این 397 جایگاه متغیر و 293 جایگاه حاوی اطلاعات در توالی های ITS وجود داشت، به ترتیب 6.51% و 44.66% آنالیز سیستماتیک مولکولی توالی های ITS برای گونه های مورد مطالعه آشکار ساخت که گونه A. scabriscapum در زیر جنس Reticulatobulbosa، با حمایت شاخه ایی بالا رابطه خویشاوندی نزدیکی با A. oleraceum در زیر جنس Allium دارد. گذشته از این A. sphaerocephalon و A. iranicum که در بخش Allium طبقه بندی شده اند در شاخه ایی یکسان قرار نگرفته اند. طبقه بندی مابقی بخش ها کاملا با طبقه بندی جدید مطابقت دارد

کلیدواژه ها:

آلیوم ، آنالیز ، ITS ، Bayesian ، بیشینه صرفه جویی ، تاکسونومی مولکولی