توالییابی نمونه قارچی با کد شناسایی 81 از طریق نواحی ITS1 و ITS4

با پیشرفت های اخیر در زیست شناسی مولکولی و توسعه فناوری هایی مثل توالی یابی ژنی و ژنومی، کشف و شناسایی گونه های جدید در گروه های مختلف موجودات زنده به ویژه قارچ ها روند افزایشی به خود گرفته است. همچنین با توجه به ناکارآمدی روش های مبتنی بر مورفولوژی برای شناسایی گونه های قارچی، استفاده از تکنیک های جدید مبتنی بر داده های DNA، جایگاه خاصی را در شناسایی سریع و دقیق گونه های قارچی پیدا کرده است. توالی یابی از طریق نواحی فاصله انداز بین ژنی اپران RNA ریبوزومی یکی از این تکنیک ها می باشد. بدین منظور ژن نمونه با کد شناسایی 18 پس از جداسازی و استخراج DNA وتکثیر با PCR توسط شرکت Bioneer توالی یابی شد، سپس توالی شناسایی شده پس از ویرایش، در موتور جستجوی بانک جهانی (NCBI) مورد همردیفی (BLAST) قرار گرفت. نتایج بدست آمده از طریق همردیفی و آنالیز خوشه-ای روابط فیلوژنی نشان داد که نمونه قارچی با کد شناسایی 18 دارای همولوژی بالای 99 درصد با گونه های دو جنس Microsphaeropsis و Phoma می باشد.

کلیدواژه ها:

توالی یابی ، فاصله انداز ، فیلوژنی ، گونههای قارچی ، همردیفی ، همولوژی