ارزیابی بیوانفورماتیکی hsa-miR-514b-5p مرتبط با پلی مورفیسم تک نوکلیوتیدی(rs73016210) ژن IL6R و ابتلا به سرطان پستان

سرطان پستان از شایع ترین سرطان ها در بین زنان است. ژن IL6R بر روی کروموزوم 1 در جایگاه 1q21 قرار دارد. بررسی ها مشخص کرده این ژن در ارتباط با سرطان پستان میباشد. مهار IL6 با استفاده از مهار کننده IL6R ممکن است یک گزینه درمانی و پیشگیری از سرطان پستان تبدیل شود. پلی مورفیسم های تک نوکلیوتیدی جز مارکرهای ژنتیکی مرتبط با بسیاری از بیماری های ژنتیکی میباشد. microRNA ها به عنوان بیومارکر با تنظیم و کنترل بیان ژنها در سطح mRNA اثر خود را اعمال می کنند. هدف ما ارزیابی بیوانفورماتیکی hsa-miR-514b-5p مرتبط با پلی مورفیسم تک نوکلیوتیدی(rs73016210) ژن IL6R و ابتلا به سرطان پستان میباشد. بدین منظور پایگاههای داده NCBI، miRNASNP، miRBase، phenomir،miRWALK2.0 و DAVID مورد استفاده قرار گرفته است. بررسی ها در رابطه با rs73016210 مشخص ساخت که در جایگاه این SNP آلل G به A تبدیل می شود، که ممکن است براتصال و عملکرد میکرو RNAهای مرتبط با این ناحیه اثر گذار باشد. بررسی های انجام شده بر روی hsa-miR-514b-5p مشخص ساخت که این microRNA با قدرت بالایی به 3’UTR رونوشت ژن IL6R متصل می شود و عمل مهاری خود را اعمال می کند. با توجه به تایید نقشhsa-miR-514b-5p در سرطان پستان از طریق پایگاه های داده از جمله phenomir، بدست آوردن ژن های هدف آن از طریق پایگاه داده miRWALK2.0 و ارزیابی مسیرهای سیگنالینگ مرتبط با استفاده از پایگاه داده DAVID، این میکروRNA به منظور آنالیزهای بعدی انتخاب گردید. بر این اساس آلل G در جایگاه این SNP میتواند با بروز سرطان پستان در ارتباط باشد.

کلیدواژه ها:

پلی مورفیسم تک نوکلیوتیدی((rs73016210 ، IL6R ، میکروRNA(hsa-miR-514b-5p) ، سرطان پستان