ارزیابی بیوانفورماتیکی مسیرهای سیگنالی تارگتوم hsa-miR-3934 و عملکرد SNP مرتبط با آن(rs2976394) در افراد مبتلا به سرطان معده
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: کنگره ملی پژوهش و نوآوری در زیست فناوری
- کد COI اختصاصی: NCRIB01_002
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1044
نویسندگان
بخش ژنتیک، گروه زیست شناسی، موسسه آموزش عالی نوردانش، میمه، اصفهان، ایران
بخش زیست شناسی سلولی م مولکولی، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، شهرک پژوهش ، کیلومتر ۱۵، بزرگراه تهران-کرج ، تهران، ایران
زیست فناوری نوین، آموزشگاه بیوتکنولوژی، اصفهان، ایران
چکیده
در سال های اخیرسرطان معده دومین علت مرگ و میر در اثر سرطان به شمار می رودکه علاوه بر هزینه های قابل توجه، مشکلات عدیده ای را بر خانواده ها تحمیل نموده و خود توجیه مناسبی جهت شناسایی بیومارکرهای مرتبط می باشد.. بدین علت برای یافتن اطلاعات بیوانفورماتیکی یشتر در این رابطه سایت های NCBI، miRNASNP، miRBase، phenomiR ، miRWALK2.0 و DAVID مورد استفاده قرار گرفت. مطالعات انجام شده در سایت های NCBIبیانگر آن است که یکی از ژن های درگیر با این بیماری ژن PSCA در جایگاه کروموزومی 8q24.2 می باشد. در این ارتباط به منظور شناسایی میکرو RNAهای مرتبط با آن از پایگاههای داده miRNASNP و miRdSNP استفاده شد. بررسی ها در جایگاه rs2976394 مشخص ساخت که آلل C به T تبدیل میشود، که ممکن است براتصال و عملکرد میکرو RNAهای مرتبط با این ناحیه اثر بگذارد. در نهایت hsa-miR-3934 به عنوان یکی از مهمترین میکرو RNAهای مرتبط با این ژن مشخص شده و با توجه به تایید نقش hsa-miR-3934 در سرطان معده از طریق پایگاههای داده بیوانفورماتیکی از جمله phenomiR، بدست آوردن ژن های هدف آن از طریق پایگاه داده miRWALK2.0 و ارزیابی مسیرهای سیگنالی مرتبط با آن با استفاده از پایگاه داده DAVID، این میکرو RNA به منظور آنالیزهای بعدی انتخاب گردیدکلیدواژه ها
سرطان معده، بیوانفورماتیک، ژن PSCA،میکروRNA(has-miR-3934) ، چندریختی تک نوکلیوتیدی rs2976394مقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.