چالش روشهای خوشه بندگی گراف در داده های زیستی: پایین بودن قابلیت توجه دقت

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 698

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CITCONF03_636

تاریخ نمایه سازی: 12 تیر 1395

چکیده مقاله:

یکی ازمعمترین مسائلی که در حوزه ی بیوانورماتیک وجود دارد یافتن خصوصیات پروتئینها مانند نحوه ی بیان یک فرایند زیستی خاص راانجام می دهند با پیشرفت تکنولوژیهای ازمایشگاهی در تشخیص تعامل میان پروتئینها حجم زیادی از داده های آزمایشگاهی شامل اطلاعات تعامل پروتئینی در اختیار محققان قرار گرفته است. در این مقاله ابتدا الگوریتم های مختلف جهت تشخیص خوشه های پروتئینی را بیان می کنیم و سپس به معرفی معیارهای ارزیابی مختلف برای مقایسه ی بین این الگوریتم ها پرداخته ایم. درپژوهش های بسیاری مورد مطالعه قرار گرفته است مسائل مورد بررسی در این پژوهش به یکی از شاخههای علم بیوانفورماتیک یعنی شناسایی خوشه های پروتئینی می پردازد.

کلیدواژه ها:

خوشه های پروتئینی ، شبکه ی تعامل پروتئین - پروتئین ، الگوریتمهای تشخیص خوشه های پروتئین معیارهای ارزیابی الگوریتمها

نویسندگان

اسما ایوازه

گروه مهندسی کامپیوتر دانشکده فنی مهندسی دانشگاه تهران ایران

مسعود رهگذر

گروه مهندسی کامپیوتر دانشکده فنی مهندسی دانشگاه تهران ایران

علی مسعودی نژاد

گروه بیوانفورماتیک مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهرن ایران

جواد ظهیری

گروه بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس تهران ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Y.-P. P. Chen, Bioinformatics technologies: Springer, 2005. ...
  • _ Li, Xiaoli, et al, _ Computational approaches for detecting ...
  • G. D. Bader and C. W. V. Hogue, "An automated ...
  • J. B. Pereira-Leal, A. J. Enright, and C. A. Ouzounis, ...
  • S. Srihari, & H. V. Leong, " A survey of ...
  • Wu, Min, Xiaoli Li, Chee-Keong Kwoh, and See-Kiong Ng. "A ...
  • B. Adamcsek, G. Palla, I. J. Farkas, I. Derenyi, and ...
  • H. Fu, Pro tein-protein interactions: methods and applications vol. 261: ...
  • G. Palla, I. Derenyi, I. Farkas, and T. Vicsek, "Uncovering ...
  • A. J. Enright, S. Van Dongen, and C. A. Ouzounis, ...
  • R. Corban, V. Rachit, and B. Joel, "NeMo: Network Module ...
  • T. Nepusz, H. Yu, and A. Paccanaro, "Detecting overlapping protein ...
  • G. D. Bader and C. W. V. Hogue, "An automated ...
  • Cai, Bingjing, et al. "Integrating domain similarity to improve protein ...
  • T. Ito, T. Chiba, R. Ozawa, M. Yoshida, M. Hattori, ...
  • نمایش کامل مراجع