ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
ورود |عضویت رایگان |راهنمای سایت |عضویت کتابخانه ها
عنوان
مقاله

پیش بینی برهمکنش های پروتئین-پروتئین با استفاده از روش PPHGS-SVM

سال انتشار: 1391
کد COI مقاله: ICS11_216
زبان مقاله: فارسیمشاهده این مقاله: 1,806
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 8 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله پیش بینی برهمکنش های پروتئین-پروتئین با استفاده از روش PPHGS-SVM

سعیده محمودیان - دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس
عبدالعزیز یوسف - دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس
نصرالله مقدم چرکری - دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس

چکیده مقاله:

پروتئین ها ماکرومولکول هایی هستند که در اکثر فرایند های درون سلول نقش دارند. از قبیل انتقال، تنظیم هورمونی، سوخت و ساز بدن، تنفس و کنترل ژن ها. از طرفی اطلاعات برهم کنش های پروتئین-پروتئین که توسط فناوری های آزمایشگاهی با توان عملیاتی بالا استخراج می شوند اغلب ناکاملو نویزی می باشند. بنابراین گسترش روش های محاسباتی و داشتن مجموعه داده های برهم کنش با کیفیت بالا، برای پیش بینی برهم کنش های پروتئین-پروتئین ضروری است. هدف از این مقاله ارائه روشی برای بالابردن دقت پیش بینی برهمکنش ها می باشد. به منظور رسیدن به این هدف، روش PPHGS-SVM را پیشنهاد داده ایم که بر روی یک مجموعه داده تجمیعی اعمال شده است. بنابراین در این مقاله، از روش PCA برای کاهش ابعاد مجموعه داده استفاده کرده ایم تا با استخراج ویژگی های مهم آن، هم زمان پردازش را کم کنیم و هم دقت پیش بینی را افزایش دهیم. همچنین از روش PHGS به منظور انتخاب مناسب پارامتر ها برای دسته بند SVM بهره برده ایم و توانستیم دقت پیش بینی برهمکنش های پروتئین-پروتئین را از 5.17 % به . 5715 %بهبود دهیم. نتایج به دست آمده نشان می دهد که روش ارائه شده نسبت به روش های قبلی کارایی بهتری دارد

کلیدواژه ها:

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

کد یکتای اختصاصی (COI) این مقاله در پایگاه سیویلیکا ICS11_216 میباشد و برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/214797/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
محمودیان، سعیده و یوسف، عبدالعزیز و مقدم چرکری، نصرالله،1391،پیش بینی برهمکنش های پروتئین-پروتئین با استفاده از روش PPHGS-SVM،یازدهمین کنفرانس سراسری سیستم های هوشمند،تهران،https://civilica.com/doc/214797

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1391، محمودیان، سعیده؛ عبدالعزیز یوسف و نصرالله مقدم چرکری)
برای بار دوم به بعد: (1391، محمودیان؛ یوسف و مقدم چرکری)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

  • A. J. Enright, et al., "Protein interaction maps for complete ...
  • L. Giot, et al., "A protein interaction map of Drosophila ...
  • A. C. Gingras, et al., "Advances in protein complex analysis ...
  • T. P. Mohamed et al., "Active learning for human protein-protein ...
  • _ o _ _ _ Systems, vol. 30, pp. 39.44, ...
  • T. Dandekar, et al., "Conservation of gene order: a fingerprint ...
  • E. M. Marcotte, et al., "Detecting protein function and protein- ...
  • M .Pellegrini, et al., "Assigning protein functions by comparative genome ...
  • F. Pazos and A Valencia, "Similarity of phylogenetic trees as ...
  • L. Licamele and L. Getoor, "Predicting protein-protein interactions using relational ...
  • U. Ogmen, et al., "PRISM: protein interactionsby structural matching, " ...
  • _ _ _ dataset, " Amino acids, vol. 38, pp. ...
  • J. F. Xia, et al., "Predicting protein-protein interactions from protein ...
  • C. Y. Yu, et al., "Predicting protein-protein interactions in unbalanced ...
  • _ _ _ _ bioinformatics, vol. I1, 2010. ...
  • X. W. Chen and , Liu, "Prediction of protein-protein interactions ...
  • J. L. Morrison, et al., "A lock-and-key model for protein-protein ...
  • M. Singhal and H. Resat, " A domain-based approach to ...
  • R. Jansen, et al., "A Bayesian networks approach for predicting ...
  • X. Chen, et al., "KUPS: constructing datasets of interacting and ...
  • C .Xing and D. B. Dunson, "Bayesian Inference for Genomic ...
  • J. Shen, et al., "Predicting protein-protein interactions based only on ...
  • Y. Guo, et al., "Using support vector machine combined with ...
  • L. V. Zhang, et al., "Predicting co-complexed protein pairs using ...
  • J. Wang, et al., "Uncovering the rules for protein-protein interactions ...
  • N. Lin, et al., "Information assessment _ predicting protein- protein ...
  • L. Nanni and , Lumini, "An ensemble of K-local hyperplanes ...
  • th Iranian Conference _ Intelligent Systems February 27th & 28th, ...
  • J. F. Xia, et al., _ Sequence-based prediction of protein-protein ...
  • Y. Qi, et al., "Random forest similarity for protein-protein interaction ...
  • M. H. Zangooei and S. Jalili, "PSSP with dynamic weighted ...
  • _ _ _ Prediction, " Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Proteins ...
  • مدیریت اطلاعات پژوهشی

    صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

    اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه دولتی
    تعداد مقالات: 30,784
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    مقالات پیشنهادی مرتبط

    مقالات مرتبط جدید

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

    پشتیبانی