تشخیص و مطالعه فیلوژنی ویروس Rinderpest با تکنیک RT-PCR و توالی یابی ژن F در ایزوله های ایران

ویروس طاعون گاوی از مهلک ترین ویروس های گاو می باشد که به سرعت منتشر شده و خسارات اقتصادی را به بار می /اورد. به منظور دستیابی به تکنیکی سریع و دقیق جهت شناسایی ویروس و مطالعه فیلوژنی و مشخص کردن مسیر احتمالی ورود ویروس به کشور اقدام به راه اندازی روش مولکولی با الگو قرار دادن ژن F منطقه Cleavage site نمودیم. ابتدا نمونه های عقده لنفاوی گاوهای مشکوک به طاعون دریافت شد و اقدام به خالص سازی RNA و سپس تکثیر قطعه ای به طول 370bp از ژن F گردید. جهت تأیید اقدام به انجام nested-PCR و به منظور مطالعه فیلوژنی محصولات حاصل از PCR از نمونه های مثبت به داخل وکتور مناسب کلون شده مورد توالی یابی قرار گرفت با بررسی قسمت Cleavage site دیده می شود که در ایزوله های ایران توالی RRHKR سوش های بیماری زا وجود دارد و در سوش واکسن موسسه این توالی RRHRR می باشد که مشابه سایر سوش های واکسن RBOK است. مطالعه فیلوژنی ویروس های RPV ایران تشابه 99% را به ایزوله مطالعه شده در کشور روسیه به نام Strain-K نشان می دهد که توالی Cleavage site در این ایزوله نیز rrhkr می باشد. تشابه ایزوله های ما با سوش روسی به مراتب بیشتر است تا با ایزوله های ترکیه عمان و عربستان در سال 1981 که می توان منشا مشترکی برای این دونمونه تصور نمود.