بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت خیار دریایی Holothuria parvaبا استفاده از توالی یابی ژن ریبوزومال میتوکندری ( 16s Rrna) در خلیج فارس

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 799

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

KMSU01_141

تاریخ نمایه سازی: 1 آذر 1394

چکیده مقاله:

به منظور شناسایی و تعیین ساختار و مقایسه تنوع ژنتیکی خیار دریایی Holothuria parva در دو منطقه بندر بستانه و بندر دیر، روش توالی یابی ژن 16srRNA بکار رفت. به این منظور پس از نمونه برداری از ایستگاه ها، استخراج DNA به روش استات آمونیوم انجام گرفت. آغازگرهای مورد استفاده با به کار گیری نرم افزار Oligo7 طراحی گردید و با استفاده از آن ها واکنش های زنجیره ای پلیمراز صورت گرفت. پس از تکثیر ،محصولات توسط دستگاه توالی یاب خودکار، توالی یابی شدند. بعد از تعیین توالی، آنالیز توالی ها با استفاده از نرم افزارهای Chromas،BioEdite ، MEGAو DnaSP انجام شد. در مجموع 417 جایگاه نوکلئوتیدی مورد مطالعه قرار گرفت که پس از بررسی در پایگاه داده ای NCBI توالی ها با ژن 16s rRNA همخوانی داشتند و تعلق نمونه ها به گونه Holothuria parva مورد تایید قرار گرفت. در مجموع در دو منطقه 4 هاپلوتایپ شناسایی شده که یکی از هاپلوتایپ ها در دومنطقه مشترک بوده است. بندر بستانه دارای 3 هاپلوتایپ و بندر دیر دارای 2 هاپلوتایپ بودند. تنوع هاپلوتایپی در بستانه 83% و در دیر 50% تخمین زده شد. تنوع نوکلئوتیدی در بستانه و دیر به ترتیب 0/007 و 0/002 برآورد شد. تمایز ژنتیکی (Fst) ناچیز 0/000 و نرخ واگرائی (Dxy) 0/0048 و جریان ژنی (Nm) بالا 1874 بین دو منطقه برآورد گردید. بر اساس نتایج به دست آمده از این بررسی، احتمالا نمونه های بندر بستانه و بندر دیر از یک جمعیت یکسان هستند که به دلیل جریان ژنی بالا بین دو منطقه تمایز زیادی از هم ندارند و وجود هاپلوتایپ مشترک نیز بیانگر وجود نیای مشترک Holothuria parva در دو منطقه می باشد.

نویسندگان

لیلا عالمی نیسی

گروه بیولوژی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر

محمد علی سالاری علی آبادی

گروه بیولوژی دریا، علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر

حسین ذوالقرنین

گروه بیولوژی دریا، دانشکده علوم و اقیانوسی، دانشگاه علوم وفنون دریایی خرمشهر

حسین پاشا زانوسی

گروه فیزیک دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی ،دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • (1) Bruckner, A., Johnson, K. and Field, J. 2003, Conservation ...
  • (2) Calo-Mata, P., pascoal, A., Fernandez, I., Bohme, K., Gallardo, ...
  • (3) Kim, S.K and Himaya, S. 2013. Triterpenoids of Marine ...
  • (4) Lambert, PH. And Oliver, K. L., 2001. Pseudothyone levini, ...
  • (5) Lovatelli A, Conand C, Purcell P, Uthicke S, Hamel ...
  • (6) Sloan, N.A. nd Bodungen, B.V., 1980. Distribution and feeding ...
  • (7) Toral-Granda V, Lovatelli A, Vasconcellos M, 2008. Sea Cucumbers. ...
  • (8) Uthicke S, 1999. Sediment bioturbation and impact of feeding ...
  • (9) Uthicke S, Purcell S, 2004. Preservation of genetic diversity ...
  • (10) Vargara Chen C. Gonza 'lez, W.M. Pe rez-Ruzafa, A. ...
  • Department of Marine Biology, Faculty of Marine Science, Khorramshahr University ...
  • نمایش کامل مراجع