بررسی miRNA ها و شناسایی ژن های هدف آنها در گیاه برنج و آنالیز مقایسه های آنها با آرابیدوپسیس، ذرت و انگور

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,073

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NBCI08_0323

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394

چکیده مقاله:

اMicroRNA ( miRNA) ها یکی از انواع RNA های کوچک درون زاد غیرکد کننده پروتئین می باشند که در تنظیم فرایندهای گوناگون سلولی نقش دارند. همچنین تحقیقات نشان داده که miRNA ها نقش مهمی در پاسخ به تنش های محیطی ایفا می کنند. شناسایی miRNA ها در گونه های مختلف در سال های اخیر بسیار مورد توجه قرار گرفته است. در این تحقیق miRNA های گیاه برنج؛ به منظور بررسی خصوصیات ساختار ساقه- حلقه، توالی و ژن های هدف آنها با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفتند. همچنین مقایسه های بین miRNA های برنج با آرابیدوپسیس، ذرت و انگور به منظور شناسایی miRNA های حفاظت شده و ژن های هدف آنها انجام شد. نتایج نشان داد که با وجود ساختار ثانویه مشابه، توالی ناحیه ساختار ساقه- حلقه بسیار متنوع بود، با این وجود توالی miRNA بالغ در میان گونه های مختلف مورد بررسی بسیار شبیه بود. همچنین فراوان ترین نوکلئوتید در انتهای 5 مولکول miRNA با طول 20، 21 و 22 اوراسیل و برای طول 24 آدنین بود. miRNA های حفاظت شده در میان چهار گونه مورد بررسی و همچنین یک miRNA های اختصاصی برنج و یک miRNA های اختصاصی تک لپه ها شناسایی شد. ژن های هدف برای تمامی miRNA ها شناسایی شدند که عمده ترین آنها فاکتورهای رونویسی بودند.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

احسان محسنی فرد

دانشجوی دکتری دانشگاه فردوسی مشهد

محمد فارسی

هیات علمی دانشگاه فردوسی مشهد

امین میرشمسی کاخکی

هیات علمی دانشگاه فردوسی مشهد

بهنام بخشی

دانشجوی دکتری دانشگاه آزاد اسلامی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • هسنمین همابس ببو نکنولوزی جم‌هوری اسلامی ابران _ چهارمین همابس ...
  • Baulcombe, D., RNA silencing in plants. Nature, 2004. 431(7006): p. ...
  • Khraiwesh, B., J.-K. Zhu, and J. Zhu, Role of miRNAs ...
  • Axtell, M.J. and J.L. Bowman, Evolution of plant microRNAs and ...
  • Yuanyuan Ren, L.C., Yiyun Zhang, Xiangyang Kang, Zhiyi Zhang, Yanwei ...
  • Wang, C., et al., Identification of microRNAs from Amur grape ...
  • Jone s-Rhoades, M.W. and D.P. Bartel, Computational identification of plant ...
  • Jone s-Rhoades, M.W., D.P. Bartel, and B. Bartel, MicroRNAs and ...
  • نمایش کامل مراجع