معرفی EST های اختصاصی پاسخگو به تنش یونی و تنش اسمزی به روش Capture cDNA-AFLP

اثرات یونی واثرات اسمزی دو جزء اصلی تنش شوری در گیاهان می باشند. دراین تحقیق پاسخ مولکولی گیاه هالوفیت Aeluropus littoralis به اثرات مذکور با استفاده از تکنیک نوین cDNA-AFLP Capture مورد بررسی قرار گرفت. تیمار شوری کلرید سدیم (NaCl) و خشکی پلی اتیلن گلایکول (PEG) در شرایط تاریکی، یکسان سازی شده بر حسب پتانسیل اسمزی در سه سطح (شاهد) و 200 و 400 میلیولار اعمال شد. از میان 75 EST جداسازی شده، 69 EST با طول میانگین 250 جفت باز در پایگاه NCBI به ثبت رسید که بازده توالی یابی 92% بود. نتایج آزمون همردیفی نشان داد که 72% از رونشت ها با ارگانیسم های دیگر، شباهت نشان دادند. از سوی دیگر 28% از رونوشت ها به دلیل عدم تشابه قابل ملاحظه ای در آزمون های همردیفی، به عنوان ژن های جدید در نظر گرفته شدند. درصد بیان رونوشت های پاسخ گو به تنش یونی (اختصاص به NaCl) و رونوشت های پاسخ گو به تنش اسمزی( اشتراک NaCl با PEG) به ترتیب 44% و 28% بود. برخی از پروتئین های مهم دخیل در تنش یونی شامل پتاسیم ترانسپورترها و گولگین و برخی از پروتئین های مهم دخیل در تنش اسمزی شامل کولین و ریبوزوم های پروتئینی 40S می باشند. نتایج حاصل از آنالیز ESTها نشان داد. پاسخ ریشه گیاه به تنش یونی در سطح بیان، بیشتر از پاسخ گیاه به تنش اسمزی بود.

کلیدواژه ها:

اثرات یونی ، اثرات اسمزی ، DNA-AFLP Capture