شناسایی و تعیین جایگاه فیلوژنتیکی باکتری عامل سوختگی باکتریایی پنبه در ایران

سوختگی باکتریایی پنبه با عامل Xanthomonas citri subsp. Malvacearum یکی از مهمترین بیماریهای خسارتزای پنبه در ایران و جهان می باشد. در این پژوهش تعداد 37 استرین جمع آوری شده از مزارع پنبه استانهای گلستان و سمنان در سالهای 83 و 84 به همراه یک جدایه استاندارد (86-217) تهیه شده از کلکسیون بین المللی میکر وارگانیسم های جدا شده از گیاهان، که در آزمایشگاه پروکاریوتهای موسسه تحقیقات گیاه پزشکی تهران نگهداری می شوند، استفاده گردید. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی و فیلوژنی بهارگر، از تکنیک PCR و آغازگرهای طراحی شده مرتبط با ژن gyrB استفاده گردید. نتایج دندروگرام نشان داد که بر مبری توالی های نوکلئوتیدی مربوط به ژن gyrB جدایهای ایران با 100% تشابه در کنار سایر جدایهای موجود در بانک ژن (NCBI) در یک گروه فیلوژنی قرار گرفتند و از سایر باکتریهای این جنس از جمله X.oryzae و X.vasicola کاملا مجزا میباشند. بنابراین این روش در شناسایی و تفکیک دقیق جایگاه فیلوژنیک این باکتری به عنوان روش مطمئن و حساس ارزیابی می گردد ولی در تفکیک نژادهای این بهارگر موفق نبود.

کلیدواژه ها:

پنبه ، سوختگی باکتریایی ، فیلوژنی ، ژن gyrB و تکنیک PCR