بهینه سازی شرایط انجام RT-PCR به منظور ارزیابی کمی بیان ژنهای آنالوگ خانواده NBS-LRR در مرکبات آلوده به عامل میوه سبز مرکبات
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 572
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0002
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
بیماری میوه سبز مرکبات با Huanglogbing (HLB) از خطرناکترین و ویرانکنندهترین بیماریهای مرکبات است این بیماری در سال 1386 از جنوب ایران گزارش گردید. در حال حاضر استراتژی کارآمد برای کنترل این بیماری استفاده از گیاهان مقاوم و متحمل به این پاتوژنها میباشد. بیشتر پروتین های رمز شده توسط ژنهای مقاومت متعلق به خانواده (Nucleotide Binding Site Leucien-Rich Repeats : NBS LRR) می باشد. امروزه مجموعه قابل توجهی از توالی های NBS-LRR حفاظت شده در گونه های مختلف گیاهی در دسترس می باشند. در این مطالعه با استفاده از توالی های موجود از NBS-LRR در مرکبات برای طراحی پرایمرهای دجنره به منظور مطالعه کمی بیان ژنهای خانواده NBS-LRR در مرکبات آلوده به بیماری میوه سبز مرکبات استفاهه سد. پارامترهای مختلفی از جمله دمای اتصال پرامیر به الگو، غلظت پرایمر، غلظت کلرید منیزیوم و تعداد چرخه، جهت بهینه سازی شرایط PCR برای این ژنها، تغییر یافت. نتایج بررسی نشان می دهد از میان چهار جفت پرایمر دجنره طراحی شده برای ارزیابی کمی بیان ژنهای خانواده NBS-LRR در مرکبات آلوده به بیماری میوه سبز مرکبات، تنها جفت آغازگر F11/R18 پس از 34 چرخه RT-PCR و در دمایی بین 52/3 تا 59/6 درجه سانتی گراد، به صورت مشخص دیده شد، غلظت پرایمر F11/R18 در RT-PCR در محدوده 0/8 - 0/2 ماکرومول اختلاف معنی داری را نشان نداد ولی برای ژن کنترل داخلی 18S rRNA در غلظت 0/8 باند واضح تری مشاهده شد. بررسی های ما نشان می دهد F11/R18 برای مطالعه ارزیابی کمی بیان ژنهای خانواده NBS-LRR در مرکبات آلوده به عامل میوه سبز مرکبات مناسب است. این اولین گزارش از کاربرد یک پرایمر دجنره در مطالعه الگوی بیان ژنها در گیاهان می باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
کژال همزه
آزمایشگاه پروکاریوت شناسی، بخش تحقیقات بیماریهای گیاهی، موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، تهران، ایراهن
مریم غایب زمهریر
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین، ورامین، تهران، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :