بررسی ساختار سه بعدی و خصوصیات آنزیم لاکاز از دیدگاه بیوانفورماتیک
محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,506
فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_0922
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
اکسیدازهای چند مسی هستند، که اکسیداسیون دامنه وسیعی از ترکیبات فنولیک، آمینهای آروماتیک و (EC لاکازها ( 1.10.3.2 ( Loera. C et al ) . حتی ترکیبات غیرآلی مشخصی را با استفاده از اکسیژن مولکولی به عنوان پذیرنده الکترون کاتالیز میکنندهدف اصلی این تحقیق بررسی ساختار و خصوصیات آنزیم لاکاز به عنوان یک مولکول زیستی از دیدگاه بیوانفورماتیک میباشد. در این تحقیق با استفاده از بانکهای اطلاعاتی و نرم افزارهای مختلفی که در زمینه پروتئین وجود داشت، آنالیز جامعی در مورد آنزیم ,PredictProtein ,Rasmol و نرم افزارهای Uniprot و NCBI ,PDB مورد نظر انجام شد. در این راستا از پایگاههای اطلاعاتی استفاده شد. با استفاده از این نرم افزارها ساختار ثانویه Prot scale وDNAStar ,GeneDoc ,PSIPRED ,Ligand Explorer آنزیم با دقت 80 % تعیین گردید، الگوی آبگریزی و نمودار مربوط به آن ترسیم گردید، محتوی اسیدآمینهای آنزیم مشخص شد، نواحی حفاظت شده پروتئین تعیین گردید و در نهایت محل اتصال لیگاند در ساختار سه بعدی آنزیم مورد آنالیز قرار گرفت. امروزه رشد سریع دادهها و اطلاعات مربوط به پروتئینها، اهمیت بیوانفورماتیک را به عنوان ابزاری مهم در سازماندهی این اطلاعات بیشتر از هر زمان دیگری آشکار ساخته است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
محمد پرند
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه شهید بهشتی، تهران
مختارعلی عباسی
عضو هیئت علمی موسسه تحقیقات علوم دامی کشور
انیسه رستم زاده
دانشجوی کارشناسی ارشد زراعت دانشگاه صنعتی شاهرود
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :