گیاهی Na+/H+ بررسی رایانه ای و شناسایی موتیفهای موجود در پیشبر آنتی پورترهای
محل انتشار: هفتمین همایش بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 648
فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_0925
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
بررسی و شناسایی موتیف های شناخته شده در پیشبر ژ نهای مهم و پیشبینی تغییر بیان این ژ نها تحت تاثیر تن شهای زنده و غیر زنده با استفاده از تکنیکهای رایانه ای یکی از زمینه های جذاب در بیوانفورماتیک است. با استفاده از بانک های اطلاعاتی توالی 14 ژن Arabidopsis thaliana و Sorghum bicolor ،Ricinus communis گیاهی از سه گونه گیاهی Na+/H+ رمز کننده آنتی پورترهای مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند و موتیف های موجود در آنها بررسی PlantCARE و PLACE جم عآوری و با استفاده از برنامه های ،ABRE box ،CAAT box ،TATA box ، شدند. نتایج نشان دادند که توالی پیشبر این ژ نها شامل عناصر تنظیمی مختلفی مانند در طول Na+/H+ و عناصر پاسخ به زخم، خشکی، شوری و غیره است که باعث القای بیان ژن ها رمز کننده آنتی پورترهای ERE box به Na+/H+ رشد، توسعه و تحت تنش های زنده و غیر زنده می شود. نتایج این تحقیق برای اولین بار نشان م یدهد که آنتی پورترهای احتمال زیاد علاوه بر موثر بودن در تحمل به تن شهای شوری و خشکی در بسیاری دیگر از فعالی تهای فیزیولوژیک گیاه به طور مستقیم یا غیر مستقیم نقش دارند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سارا اسماعیلی
کرمان، دانشگاه شهید باهنر، دانشکده کشاورزی، بخش بیوتکنولوژی
علی محمد طالع
شیراز، دانشگاه شیراز، واحد بی نالملل، بخش زراعت و اصلاح نباتات
عباس عالم زاده
شیراز، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات، ۷۱۴۴۱۶۵۱۸
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :